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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003099`

染色体: Chr04 坐标: 47582813-47586462 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003099`
名称	SmilChr04G003099
描述	uncharacterized SmilChr04G003099
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47582813 - 47586462 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023894`
GeneID	`131023894`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023894`
原始查询	`SmilChr04G003099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryosis abundant protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836811]; symbol=AT5G66780; hit=AT5G66780; species=arabidopsis; confidence=low
产物	late embryosis abundant protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836811]; symbol=AT5G66780; hit=AT5G66780; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G66780` (AT5G66780) late embryosis abundant protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836811] identity=36.9; qcov=0.99; evalue=1.89e-12; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023894

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057809519.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057809519.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809521.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809521.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809521.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47582972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A5
`Chr4:47582972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr4:47582981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:47582988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:47583016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B133,C17
`Chr4:47583931`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A18,A19,A24,B101,B105,B112,B114,B132,B135,B136,B2,B23,B58,B64,B84,B85,C20,C41,C42,D4
`Chr4:47583939`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A18,A19,A24,B101,B105,B112,B114,B132,B135,B136,B2,B23,B58,B64,B84,B85,C20,C41,C42,D4
`Chr4:47583949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:47583966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:47583978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953537.1
TAAAATATGGTTTTTTGCATGATTTCATAAATCTTATGCGATATTAAAAGATTGAAGGTGAAAAGAATGTTGAGATTACTGAGTGCACACCGCTTGTCATATTCTTTACCAAATTATATTGTTGGAAAATCATCCAACACTAGATTTGCACGAGCTGCATCTGGGTCGGACAAATCACAAACATCAGAAAAAACAGACCAAGATAAAGATGCCAAATCCGGGGCTAATAAACCTTTAACTGGAGGAGGCTACGCCAAAAG...

XM_057953536.1
TAAAATATGGTTTTTTGCATGATTTCATAAATCTTATGCGATATTAAAAGATTGAAGGTGAAAAGAATGTTGAGATTACTGAGTGCACACCGCTTGTCATATTCTTTACCAAATTATATTGTTGGAAAATCATCCAACACTAGATTTGCACGAGCTGCATCTGGGTCGGACAAATCACAAACATCAGAAAAAACAGACCAAGATAAAGATGCCAAATCCGGGGCTAATAAACCTTTAACTGGAGGAGGCTACGCCAAAAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131023894
ATGTTGAGATTACTGAGTGCACACCGCTTGTCATATTCTTTACCAAATTATATTGTTGGAAAATCATCCAACACTAGATTTGCACGAGCTGCATCTGGGTCGGACAAATCACAAACATCAGAAAAAACAGACCAAGATAAAGATGCCAAATCCGGGGCTAATAAACCTTTAACTGGAGGAGGCTACGCCAAAAGGTCTGATGAAGAAGGTTTTGGAGCAACATATGGGGGTAATCAATCCCTCTCCAAAGATGATGAGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809519.1
MLRLLSAHRLSYSLPNYIVGKSSNTRFARAASGSDKSQTSEKTDQDKDAKSGANKPLTGGGYAKRSDEEGFGATYGGNQSLSKDDEDKIVHGNVPDAQRGQSCYGSLHGEWISMYLDQQAQIGDSCSRAPT

XP_057809520.1
MLRLLSAHRLSYSLPNYIVGKSSNTRFARAASGSDKSQTSEKTDQDKDAKSGANKPLTGGGYAKRSDEEGFGATYGGNQSLSKDDEDKIVHGNVPGMDRFIIRKSSNTNEEASQREKVPQEQVPAIQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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