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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003100`

染色体: Chr04 坐标: 47590595-47596675 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003100`
名称	SmilChr04G003100
描述	succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47590595 - 47596675 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023895`
GeneID	`131023895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023895`
原始查询	`SmilChr04G003100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit 1, mitochondrial
产物	succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G66760` (SDH1-1) succinate dehydrogenase 1-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836809] identity=90.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0134800` (SDH1) - identity=89.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005749 (GO:0005749); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0006121 (mitochondrial electron transport, succinate to ubiquinone); GO:0008177 (succinate dehydrogenase (quinone) activity); GO:0009055 (electron transfer activity); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF02910 (Succ_DH_flav_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057809522.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057809522.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057809522.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057809522.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809522.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47592569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:47592590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:47592732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:47594392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:47594743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C15,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809522.1

627 aa

314

627

FAD_binding_2

Succ_DH_flav_C

PF00890 FAD_binding_2 44-440 aa PF02910 Succ_DH_flav_C 495-627 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809522.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	44	440	1.1e-126	424.1	FAD binding domain
`XP_057809522.1`	Pfam	`PF02910`	Succ_DH_flav_C	Domain	495	627	2.4e-47	160.9	Fumarate reductase flavoprotein C-term

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953539.1
TATTAGGATATTTAATAGCCATTTAGCACTCCCAAGAATTTAACAAATCTCTTTCTCTAGCTCCTCTCTCTCGACTACCCTTTCCCCTTCTCTACCATCTGCCCCAAGAATCCCTCTCTCAAACATAGTTAGCCACAGACACACGCACTAGATCAGCATTGATTTTCTTATTCGATACTCACGCTTATAGCGATATCGAGCAGAGATGTGGCGGTGCGTTTCCCGTGGCATCCGCATTCCTTCCTCTAAATCCACCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023895
ATGTGGCGGTGCGTTTCCCGTGGCATCCGCATTCCTTCCTCTAAATCCACCGCCGCCGATTCCGTTCGCCGTCTATTCTCAACATCTAGTGGAGCAGCGCCTTCATACACGGTTGTGGATCACACCTACGATGCGGTGGTGGTTGGTGCAGGAGGCGCGGGGCTGAGGGCGGCGATAGGGCTATCAGAGCATGGATTCAACACTGCTTGCATTACCAAGCTATTTCCTACTCGCTCCCATACCGTTGCAGCTCAGGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809522.1
MWRCVSRGIRIPSSKSTAADSVRRLFSTSSGAAPSYTVVDHTYDAVVVGAGGAGLRAAIGLSEHGFNTACITKLFPTRSHTVAAQGGINAALGNMTEDDWRWHMYDTVKGSDWLGDQDAIQYMCREAPKAVIELENYGLPFSRTEDGKIYQRAFGGQSLNFGKGGQAYRCACAADRTGHALLHTLYGQAMKHNTQFFVEYFALDLLMGNDGSCQGVIALNMEDGTLHRFRAASTILATGGYGRAYFSATSAHTCTGDGNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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