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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003110`

染色体: Chr04 坐标: 47649000-47649953 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003110`
名称	SmilChr04G003110
描述	putative germin-like protein 2-1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47649000 - 47649953 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023905`
GeneID	`131023905`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023905`
原始查询	`SmilChr04G003110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative germin-like protein 2-1
产物	putative germin-like protein 2-1
Arabidopsis	`AT5G39130` (AT5G39130) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833906] identity=60.6; qcov=0.983; evalue=1.38e-94; confidence=high
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=67.8; qcov=0.891; evalue=3.41e-97; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023905

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057809535.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809535.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809535.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809535.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47649187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr4:47649187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:47649224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:47649228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:47649265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:47649276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B56,B96
`Chr4:47649278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B20,C50
`Chr4:47649291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,D1
`Chr4:47649295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr4:47649320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr4:47649326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B127,B49,C26,C27
`Chr4:47649327`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A1,A13,A14,A23,A3,A4,A7,A9,B106,B108,B11,B113,B115,B119,B122,B123,B126,B128,B129,B133,B138,B139,B16,B18,B22,B28,B30,B31,B33,B4,B40,B44,B45,B46,B51,B59,B6,B61,B62,B65,B69,B71,B72,B76,B78,B8,B81,B86,B89,B92,B95,B98,C16,C18,C19,C21,C22,C23,C24,C27,C29,C30,C31,C32,C35,C37,C38,C40,C45,C46,C47,C48,C49,C51,C53,C56,C58,C6,C60,C61,C67,C68,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C85,C86,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809535.1

230 aa

115

230

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 66-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809535.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	66	218	1.3e-52	178.1	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953552.1
ATCACAGCTACAAAAACAAAAAAGAAGATAAAGAAATATAAGTGTGCTAGTTCAAATGAAGATGGGTTTTGGTTTGTGCGCCATTAATGTTGTTGTTATGTTGTGGTGGGCTTCGATTGCATACGCAGCAGATCCCGGCCAACTTCAAGATTTCTGCGTTGCTCTTCCTGATAGCAAGTCTGATGTTTTTGTGAACGGGAAGTTTTGCAAGGACCCGAACTTGGTGGTTGCAAAGGATTTCCTTTTTCAGGGTCTAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023905
ATGAAGATGGGTTTTGGTTTGTGCGCCATTAATGTTGTTGTTATGTTGTGGTGGGCTTCGATTGCATACGCAGCAGATCCCGGCCAACTTCAAGATTTCTGCGTTGCTCTTCCTGATAGCAAGTCTGATGTTTTTGTGAACGGGAAGTTTTGCAAGGACCCGAACTTGGTGGTTGCAAAGGATTTCCTTTTTCAGGGTCTAAACATTCCCGGAAACACATCGAATCAACTTGGATCGGCCGTGACTGCAGTGAACGTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809535.1
MKMGFGLCAINVVVMLWWASIAYAADPGQLQDFCVALPDSKSDVFVNGKFCKDPNLVVAKDFLFQGLNIPGNTSNQLGSAVTAVNVNQLPGLNTLGVSLARIDYAPYGLNPPHTHPRASEALLLLEGTLYVGFVTSNPADPNQRNKLFTKYLKPGDVFIFPQGLIHFQFNVGKTNAVAFAGFGNQNPGVITIANAVFGSDPKINPDVLAKAFQVEKNIIDILQAQFWPNL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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