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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003116`

染色体: Chr04 坐标: 47709015-47714315 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003116`
名称	SmilChr04G003116
描述	uncharacterized SmilChr04G003116
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47709015 - 47714315 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023533`
GeneID	`131023533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023533`
原始查询	`SmilChr04G003116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0152500` - identity=22; qcov=0.247; evalue=1.31e-13; confidence=weak
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023533

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809060.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057809060.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809060.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809060.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809060.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47709226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr4:47709254`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B23,B32,C43,C44,C46
`Chr4:47709254`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B23,B32,C43,C44,C46
`Chr4:47709257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B139,B3,C17
`Chr4:47709278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B140,B17,B49
`Chr4:47709278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B17,B49
`Chr4:47709308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B17,B49,C31
`Chr4:47709316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B17,B46,B49,C31
`Chr4:47709317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B17,B46,B49,C31
`Chr4:47709325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A20,A6,B107,B115,B136,B20,B31,B42,B43,B44,B51,B54,B58,B71,B78,C47,C49,C78,C80,C86
`Chr4:47709338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B46,D1
`Chr4:47709373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809060.1

1011 aa

506

1011

DUF8566

Peptidase_C48

PF29561 DUF8566 148-349 aa PF02902 Peptidase_C48 832-947 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809060.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	148	349	1e-52	179.6	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057809060.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	832	947	5.2e-07	30.4	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953077.1
ATGGCGATTACCAAAGCAAAGAGAGCTGGGCAAGGTGGTTCGAAGGATAAAGGGAAACAGATTGCTACCAGCGATCATGAGGATGACGTTTTAAAAGCATATATTGCCCAAAAGAAGGGTAAAGGTATAGTGATTGGAGATAACAATTATGATGCCGATGAAAACAGAAAGAAAGAAGTTAGGTCAAAGCATAGGAATGATGAACTCATGTCGGCGATGAAGCGTGCTTTGATGGAAAGTATGTTAGACGGGGTCTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023533
ATGGCGATTACCAAAGCAAAGAGAGCTGGGCAAGGTGGTTCGAAGGATAAAGGGAAACAGATTGCTACCAGCGATCATGAGGATGACGTTTTAAAAGCATATATTGCCCAAAAGAAGGGTAAAGGTATAGTGATTGGAGATAACAATTATGATGCCGATGAAAACAGAAAGAAAGAAGTTAGGTCAAAGCATAGGAATGATGAACTCATGTCGGCGATGAAGCGTGCTTTGATGGAAAGTATGTTAGACGGGGTCTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809060.1
MAITKAKRAGQGGSKDKGKQIATSDHEDDVLKAYIAQKKGKGIVIGDNNYDADENRKKEVRSKHRNDELMSAMKRALMESMLDGVLNKRKKMDVVENPEQETSDDSIKDGGSPVAVVKKTRYEKRKEGMVNYEDLVVRPYADYPTLFTRTTPSVLVKAMEDMNEQQKNAVSALGFDHLLDLTIKELPGKLNYWLIHSYNARTSEIVLPSGKTIPVTEEDVYRVLGFPRGYKNIDLVDNDDITPLFEDWKARFPGRNPRRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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