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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003118`

染色体: Chr04 坐标: 47733109-47736646 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003118`
名称	SmilChr04G003118
描述	vicilin-like seed storage protein At4g36700
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47733109 - 47736646 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023913`
GeneID	`131023913`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023913`
原始查询	`SmilChr04G003118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vicilin-like seed storage protein At4g36700
产物	vicilin-like seed storage protein At4g36700
Arabidopsis	`AT4G36700` (AT4G36700) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829823] identity=42.3; qcov=0.685; evalue=1.16e-91; confidence=medium
Rice	`Os03g0197300` - identity=36.4; qcov=0.712; evalue=1.14e-79; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057809541.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057809541.1`
3	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057809541.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809541.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809541.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47733461`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A11,A8,B102,B121,B81,C20,C21,C23,C35,C41,C48,C50,C55,C59,C6,C63,C71,C81,C87
`Chr4:47733463`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B102,C20,C21,C23,C35,C48,C50,C55,C59,C6,C81
`Chr4:47733526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C44
`Chr4:47733633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:47733666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:47733769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C36
`Chr4:47734753`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr4:47734753`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C37
`Chr4:47734827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B70,B88
`Chr4:47736286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B120,B87,C33,C36
`Chr4:47736489`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	B113,B119,B124,B135,B35,B44,B70,B88,C16,C51,C58,C79,C8,C80,D11,D3,D7
`Chr4:47736541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B76,B98,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809541.1

590 aa

295

590

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 86-219 aa PF00190 Cupin_1 285-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809541.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	86	219	1.1e-38	132.9	Cupin
`XP_057809541.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	285	436	1.1e-38	132.9	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953558.1
TTAATGATGTACTATTATATTTTTGGAATACAAAATATCCAGAATGTAATTAGAAAAAAATGAGGTTCCACGTGTCCATGCAAAAGCCACGTAGCTCTCCCCCTCCCCTCTGCCTATTTAGTGGCCCTTTCTTTGAAGGGAGGCATTGTGTGTTTGAATTGAGTAATTGTAAATTAGGAAAAATGTGGAAGAGAAAAGGCGTAGTTGTGCAATGTTATCTAATTTTGTTAACAATTTGTTTTTGTGTGAGAGTGCATGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023913
ATGAGGTTCCACGTGTCCATGCAAAAGCCACGTAGCTCTCCCCCTCCCCTCTGCCTATTTAGTGGCCCTTTCTTTGAAGGGAGGCATTGTGTGTTTGAATTGAGTAATTGTAAATTAGGAAAAATGTGGAAGAGAAAAGGCGTAGTTGTGCAATGTTATCTAATTTTGTTAACAATTTGTTTTTGTGTGAGAGTGCATGCAGAAGGTGTGCGGGCTTCGGGCCCTCTTGTGAAGAAAGAAGAGAGGTGGCCCGTGATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809541.1
MRFHVSMQKPRSSPPPLCLFSGPFFEGRHCVFELSNCKLGKMWKRKGVVVQCYLILLTICFCVRVHAEGVRASGPLVKKEERWPVISNEYGEISAVRISDAINGSYLLHFFTLEPNSLLLPLLLNAHMLFYVHAGSGRVSWTEEDELKHMNINRGDVYRLAQGSVLYMRSEDQGLKIHAIFANSNDDLREPATQPYSSIQDLVLGFDKTILQATFKVSELVIDELLGGTKPPLITQVDNICGGDLDCNVFELNKKKKKDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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