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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003119`

染色体: Chr04 坐标: 47756821-47758790 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003119`
名称	SmilChr04G003119
描述	scarecrow-like protein 15
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47756821 - 47758790 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023914`
GeneID	`131023914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023914`
原始查询	`SmilChr04G003119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 15
产物	scarecrow-like protein 15
Arabidopsis	`AT4G36710` (HAM4) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829824] identity=48; qcov=1.04; evalue=1.14e-132; confidence=high
Rice	`Os02g0662700` (OsHAM1) - identity=36; qcov=0.906; evalue=1.72e-53; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809542.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809542.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809542.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809542.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809542.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47757339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:47757346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr4:47757675`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B40,C38,C44
`Chr4:47757675`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B40,C38,C44
`Chr4:47757681`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B40,C38,C44
`Chr4:47757681`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B40,C38,C44
`Chr4:47757690`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D3
`Chr4:47757690`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D3
`Chr4:47757753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C16
`Chr4:47757897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,D11
`Chr4:47757901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B63,B83
`Chr4:47757910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B63,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809542.1

447 aa

224

447

GRAS

PF03514 GRAS 93-446 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809542.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	93	446	4.8e-92	309.5	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953559.1
TACTTGTTGTGAGTCTTGATCAACAAGCTTCCGACAAATACATCAATCAATCCTCTAATTTTAATCTTCTCACTTACTCCAACCCGACCCCACCTACATGTATTGTCTGCGTCTTAATATAGCATGATCATCATACACTAACATCTTATTAATTAATTTATAAAAAAATTCGATTTTTCAAACGGGGCCCCACCCCACCACCACCGCAATGCCATCCCCATGCACGCAAAGTTAAAAAGGCAACAACGATGATCCACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023914
ATGAAAGTGCCCTTCCCTGCAAAGAGAGCAGCAGCAGAAGCATCCCGCCCCTACGAGCCCAAATCCGTCCTCGAGCTCCGAGGAAGCCCGAGCCCGGTGGGCGAGCAGAAGATCATCAGCGAACTGGAGGATCATGTGCTGATCAGCCCACAATTGGACGAGTGGGATTCCTTGATGAGAGATTTGGGGCTGCACGACGACCCCAACCCCGATTTCGGCCTCCTCTCCGATATCCCGCCTCAAAACCCTATCGCCGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809542.1
MKVPFPAKRAAAEASRPYEPKSVLELRGSPSPVGEQKIISELEDHVLISPQLDEWDSLMRDLGLHDDPNPDFGLLSDIPPQNPIADLVGSDYVDDLIRLAECFETNSLQLAHLILARLNQRLRSASGKPLQRAAFYLKEALQSLLTGSTPPMHQPQEIIHTIKAHKTFSSISPIPMFSSFTANQALLDALHGSMLLHVIDFDIALGGHWASFLRDLSDNPDARNPALRISALVPEDYAAESTLIRDNLTHFARELNISFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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