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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003125`

染色体: Chr04 坐标: 47861701-47866822 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003125`
名称	SmilChr04G003125
描述	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47861701 - 47866822 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023921`
GeneID	`131023921`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023921`
原始查询	`SmilChr04G003125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit-like
产物	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit-like
Arabidopsis	`AT5G66680` (DGL1) dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferase 48kDa subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836801] identity=75.7; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0209000` (OsDGL1) - identity=72.3; qcov=0.936; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0008250 (oligosaccharyltransferase complex); GO:0018279 (GO:0018279)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03345 (OST48_N); PF23358 (OST48_MD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023921

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057809556.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057809556.1`
3	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057809556.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809556.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47862073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr4:47862101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B114,C37,C46,D6
`Chr4:47862306`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A22,B58,C28
`Chr4:47862306`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A22,B58,C28
`Chr4:47864931`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr4:47864931`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr4:47865541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B63,C53,D6
`Chr4:47865570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:47866505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809556.1

439 aa

220

439

OST48_N

OST48_MD

PF03345 OST48_N 29-290 aa PF23358 OST48_MD 301-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809556.1`	Pfam	`PF03345`	OST48_N	Domain	29	290	2e-69	234.5	OST48, N-terminal domain
`XP_057809556.1`	Pfam	`PF23358`	OST48_MD	Domain	301	438	9.5e-47	159.3	OST48 middle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953573.1
CAAAACAAGGCATTGTTGGCAATTTTGAGAAAAAGTTAAGTTAAATTAACCTTGAATTAAAACAAGTCAAGTGTTTGCGTCACACACCCAGCCATATTTGGGCCTTCTACACTCGCAGCACTGTCACTGCCTTTGCTGCTAAACCCTTAGCTCAAAACTCAAAAATGGCAGCGCCCAAATTCGCCTTCCTCCTATTCAACCTGATTTCACTCCTGCCTCTCCTCGTCTCCTCCTTCTCCGCCGATCACCCAACCGATCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023921
ATGGCAGCGCCCAAATTCGCCTTCCTCCTATTCAACCTGATTTCACTCCTGCCTCTCCTCGTCTCCTCCTTCTCCGCCGATCACCCAACCGATCGCCGGATTCTTGTTTTGCTCGACGATCTCTCCCTCAAATCCTCGCATTCCCTATTCTTCTCATCCCTAAAATCCCGAGGTTTCGATCTCGATTTCAAGCTCGCCGACGATCCCGCCATAGCGGTCAAGCGATATGGACAGTACATGTACGATGGGCTTATTCTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809556.1
MAAPKFAFLLFNLISLLPLLVSSFSADHPTDRRILVLLDDLSLKSSHSLFFSSLKSRGFDLDFKLADDPAIAVKRYGQYMYDGLILLSPSTERFGGSLDMDGVLDFVDSGHDLILAADANASDLIRNIAAECGVDFDEDPSAVVVDHTSYAVSETEGDHTLIAADNFIQSDIILGNKKIEAPVLFKGIGHSLNPGNNMVLKALSASSSSYSTNPSSKLSSLPPSLYGTAISLVSVVQARNDARIMISGSLDMFSNRLFRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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