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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003135`

染色体: Chr04 坐标: 47940880-47947154 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003135`
名称	SmilChr04G003135
描述	uncharacterized SmilChr04G003135
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47940880 - 47947154 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023930`
GeneID	`131023930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023930`
原始查询	`SmilChr04G003135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833859]; symbol=AT5G38690; hit=AT5G38690; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833859]; symbol=AT5G38690; hit=AT5G38690; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G38690` (AT5G38690) Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833859] identity=41.1; qcov=0.471; evalue=6.92e-70; confidence=medium
Rice	`Os05g0300700` - identity=50.2; qcov=0.301; evalue=1.83e-48; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10497 (zf-4CXXC_R1); PF15612 (WHIM1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023930

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809572.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809572.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809572.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809572.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47941329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B40,D7
`Chr4:47941336`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C51,C71,C79
`Chr4:47941336`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C51,C71,C79
`Chr4:47943442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B122,B33
`Chr4:47943466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr4:47943485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B36,C12,D1,D6
`Chr4:47944129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B48
`Chr4:47944129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:47944228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B86
`Chr4:47944754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:47944776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:47945312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809572.1

667 aa

334

667

zf-4CXXC_R1

WHIM1

PF10497 zf-4CXXC_R1 48-147 aa PF15612 WHIM1 487-512 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809572.1`	Pfam	`PF10497`	zf-4CXXC_R1	Domain	48	147	3.9e-36	123.9	Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1
`XP_057809572.1`	Pfam	`PF15612`	WHIM1	Motif	487	512	3.6e-06	27.1	WSTF, HB1, Itc1p, MBD9 motif 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953589.1
GGGAATTAGAAGTGGCGGGAAATGCACAATATTTTGGTTGGCGCTTTTGTTTGAATGGAAAATTGAAAGTCCCTCCACTCTCCGCGCATCTACTAAGACAAATGGAGCAGCCAAGTGCTCCTCTGTCCTAACCAACTCATACTTTTAAATACTCTCTCCACTTTCACGCTAAATACTTCCCAAAGTTCTGTGTTGGTTGGAAGCTTTCCGGCCACAATGGCGGTTGATTCAGGCGCTGCTTCCAATCAGTTACTCAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023930
ATGGCGGTTGATTCAGGCGCTGCTTCCAATCAGTTACTCAAGAGCCCTAACAAGCTCACCAAATCCCAAAAAGATGCTCCTCTTTCTCCAAAGGCCAAGCGAAACAATTCACCTGGCATCCGGCTTGTCGGTGGTCGGATTTATGATTCCGTCAACGGAAAAACTTGTCATCAGTGTCGCCAAAAAACCAGGGATTTTACTGCTGCATGCAAGAATCAGAAGAATAACAAGCCATGTACAATTATGTATTGTCATAAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809572.1
MAVDSGAASNQLLKSPNKLTKSQKDAPLSPKAKRNNSPGIRLVGGRIYDSVNGKTCHQCRQKTRDFTAACKNQKNNKPCTIMYCHKCLLNRYGEKAEEVDALGEWSCPKCRSICNCSVCMKKRGHQPTGILIKTAKATGFSSVSEMLLKGAQHLNCEKVVAKMAASPKKQVAPSPRKRGKENSFDGKVDANLPIDTDKNSKKVKKVHKGNKDDQSPDKRKLEHEAFAEMYDRNKKHEAEGTGSCGAEKSKQIKRGRSYEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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