当前解析结果
SmilChr04G003136| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003136 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003136 |
| 描述 | 14-3-3-like protein |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 47951279 - 47953936 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023931 |
|---|---|
| GeneID | 131023931 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023931 |
| 原始查询 | SmilChr04G003136 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 14-3-3-like protein |
| 产物 | 14-3-3-like protein |
| Arabidopsis | AT3G02520 (GRF7)ral regulatory factor 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821060] identity=90.6; qcov=0.97; evalue=4.72e-170; confidence=high |
| Rice | Os02g0580300 (GF14E)- identity=88; qcov=0.981; evalue=2.22e-171; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007165 (signal transduction) |
| KEGG | smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00244 (14-3-3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023931 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057809573.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057809573.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057809573.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809573.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809573.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:47952099 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B117,B122,B33,B41,D7 |
Chr4:47952346 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B122,B33,B41,D7 |
Chr4:47952406 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,C12 |
Chr4:47952481 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B59,B60,D11 |
Chr4:47952607 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B33 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809573.1PF00244
14-3-3 14-238 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809573.1 |
Pfam | PF00244 |
14-3-3 | Repeat | 14 | 238 | 3.9e-106 | 354.3 | 14-3-3 protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。