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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003158`

染色体: Chr04 坐标: 48212281-48216406 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003158`
名称	SmilChr04G003158
描述	uncharacterized SmilChr04G003158
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48212281 - 48216406 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023537`
GeneID	`131023537`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023537`
原始查询	`SmilChr04G003158`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=29.1; qcov=0.731; evalue=2.65e-14; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023537

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809065.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809065.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057809065.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809065.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809065.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48212296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B121,B83,C40
`Chr4:48212303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B54,B71,B8,C74
`Chr4:48212310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:48212334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B25,C51
`Chr4:48212351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr4:48215911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C52
`Chr4:48215937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:48215984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B90,B92,C31,C77,C81
`Chr4:48216004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C27
`Chr4:48216005`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B100,B16,B40,C44,C52
`Chr4:48216005`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B100,B16,B40,C44,C52
`Chr4:48216051`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953082.1
ATGGTGGCGAGTATGGGATATTCCCTCTCGTGCGTGGACCACCATCTCAAGACGTCAAATTGTATACCACCTACATTTTTGAAAGCAAATAACTACGACAATGCGTCAATTCATCCCTATGGGGGCTTTTTCACGGTTAAATTCTCGAAGCTGGACAATAAAAGGAAAGCCAAGGAGAAGGCTGTTTTAGAGCTATCAACAAGTCATATTAGACTTCGTGAATGGAATCGCTATTTCAACCCCTATAAGGATGCTTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023537
ATGGTGGCGAGTATGGGATATTCCCTCTCGTGCGTGGACCACCATCTCAAGACGTCAAATTGTATACCACCTACATTTTTGAAAGCAAATAACTACGACAATGCGTCAATTCATCCCTATGGGGGCTTTTTCACGGTTAAATTCTCGAAGCTGGACAATAAAAGGAAAGCCAAGGAGAAGGCTGTTTTAGAGCTATCAACAAGTCATATTAGACTTCGTGAATGGAATCGCTATTTCAACCCCTATAAGGATGCTTCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809065.1
MVASMGYSLSCVDHHLKTSNCIPPTFLKANNYDNASIHPYGGFFTVKFSKLDNKRKAKEKAVLELSTSHIRLREWNRYFNPYKDASSLTELWMRIYYLSMWTQEIIVGIGYELGRPLCIDHVSAHGVVGHFARVLVEVDMAQPFLESMYIDDDNNAFYIELGFETLSLYCSHCKITGHSTDKCRKVLKSKVDEGENKAAIVAAPKPKKPRGITKPA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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