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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003162`

染色体: Chr04 坐标: 48250081-48254606 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003162`
名称	SmilChr04G003162
描述	chloroplastic group IIB intron splicing facilitator CRS2-B, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48250081 - 48254606 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023955`
GeneID	`131023955`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023955`
原始查询	`SmilChr04G003162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloroplastic group IIB intron splicing facilitator CRS2-B, chloroplastic-like
产物	chloroplastic group IIB intron splicing facilitator CRS2-B%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G16140` (AT5G16140) Peptidyl-tRNA hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831471] identity=74.2; qcov=0.871; evalue=3.72e-120; confidence=high
Rice	`Os01g0132800` - identity=73.6; qcov=0.851; evalue=1.3e-117; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0004045 (peptidyl-tRNA hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01195 (Pept_tRNA_hydro)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023955

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809605.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057809606.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809605.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809605.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809605.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48253259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B3,C13,C71
`Chr4:48253333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:48253375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:48254358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B129
`Chr4:48254358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809605.1

282 aa

141

282

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 89-276 aa

XP_057809606.1

249 aa

124

249

Pept_tRNA_hydro

PF01195 Pept_tRNA_hydro 56-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809605.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	89	276	4.3e-64	216.5	Peptidyl-tRNA hydrolase
`XP_057809606.1`	Pfam	`PF01195`	Pept_tRNA_hydro	Domain	56	243	3e-64	217.0	Peptidyl-tRNA hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953622.1
CACAAAATCAATTCCCAGTTTCTTCCCAACATATCCCATCTACATAAATCCGTAGCAATTTAATTGAAGTGTGCTATAACTAGGCAAATGAATCAACTAAGCCATAATCTAGCAAGCAGCAAATAAAGGCATAATCTTCCAACTAAGCATCCATACTCCGAGTGCCCCAACCTGAGCTCGTTGCGCCGCCAGCAGCTCATTAGGAAATGCCCCATTCTCTGCAGCCCAATGCTCCATTCTCCACAGCCCAAACAAATTCT...

XM_057953623.1
AATCTTAAGCCGCAGCATCTTTGTTTCTGCTTCTGCTTCTTCTTCTCAATTCCTGCTACTCTCGACATTGGTACGCACTTCACATTTACAGTTTCTTCTGTAAAACAATCTCTCATCAGCAAAGGCGACGGCAATAAACACTTGTTCGTGCTACCTATAACAGATTGGAGGCCTATCAATAAAGGTCGATGTTGTATGCAGTTTCTTTTCCTAATACTTGCACGAGCAGCAGCATCTCTTATCCCAGAGTGAAAGTTCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023955
ATGCCCCATTCTCTGCAGCCCAATGCTCCATTCTCCACAGCCCAAACAAATTCTCTGCAGCCCAAACAGATCAAAGTCTGGTTCCAGAAGCGCAGGTCGATGTTGTATGCAGTTTCTTTTCCTAATACTTGCACGAGCAGCAGCATCTCTTATCCCAGAGTGAAAGTTCCAAATTGTCATGAAAAGCATTCAGCTCCAACAAGGTTTCGAGTCTCTGCCTCCACAGCCGAGCCCAATGGGGTCAAGACCGAGTACACTCC...

LOC131023955
ATGTTGTATGCAGTTTCTTTTCCTAATACTTGCACGAGCAGCAGCATCTCTTATCCCAGAGTGAAAGTTCCAAATTGTCATGAAAAGCATTCAGCTCCAACAAGGTTTCGAGTCTCTGCCTCCACAGCCGAGCCCAATGGGGTCAAGACCGAGTACACTCCTTGGCTAATTGTGGGATTAGGGAACCCTGGAAACAAATATCACGGAACCCGCCACAATGTCGGGTTTGAAATGGTTGATCGCATCTCTCAAGTGGAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809605.1
MPHSLQPNAPFSTAQTNSLQPKQIKVWFQKRRSMLYAVSFPNTCTSSSISYPRVKVPNCHEKHSAPTRFRVSASTAEPNGVKTEYTPWLIVGLGNPGNKYHGTRHNVGFEMVDRISQVEGIVMNTIQSKALVGIGSIGEVPVLLAKPQTYMNFSGEAVGSLAAYYQVPLRHILLVYDEMSLPNGVLRLQPKGGHGHHNGVKSVMEHLDGRREFPRFCIGIGNPPGTMDMKAFLLQKFSTLERRQVDAALEQGIEAARSLV...

XP_057809606.1
MLYAVSFPNTCTSSSISYPRVKVPNCHEKHSAPTRFRVSASTAEPNGVKTEYTPWLIVGLGNPGNKYHGTRHNVGFEMVDRISQVEGIVMNTIQSKALVGIGSIGEVPVLLAKPQTYMNFSGEAVGSLAAYYQVPLRHILLVYDEMSLPNGVLRLQPKGGHGHHNGVKSVMEHLDGRREFPRFCIGIGNPPGTMDMKAFLLQKFSTLERRQVDAALEQGIEAARSLVLEGFTGRIKRFNLGQKYKYHQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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