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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003200`

染色体: Chr04 坐标: 48843856-48845418 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003200`
名称	SmilChr04G003200
描述	L-ascorbate peroxidase 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48843856 - 48845418 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020103`
GeneID	`131020103`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020103`
原始查询	`SmilChr04G003200`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate peroxidase 3-like
产物	L-ascorbate peroxidase 3-like
Arabidopsis	`AT4G35000` (APX3) ascorbate peroxidase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829652] identity=68.5; qcov=1.05; evalue=1.07e-130; confidence=high
Rice	`Os04g0223300` (OsAPx3) - identity=73.8; qcov=0.908; evalue=4.83e-126; confidence=high
GO	GO:0000302 (response to reactive oxygen species); GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0020037 (heme binding); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020103

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057804754.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057804753.1`
3	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057804752.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057804752.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48843945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B136,C56
`Chr4:48844052`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B16,B40,C44
`Chr4:48844052`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B16,B40,C44
`Chr4:48844092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804752.1

276 aa

138

276

peroxidase

PF00141 peroxidase 11-217 aa

XP_057804753.1

275 aa

138

275

peroxidase

PF00141 peroxidase 11-216 aa

XP_057804754.1

262 aa

131

262

peroxidase

PF00141 peroxidase 11-203 aa

XP_057804756.1

261 aa

130

261

peroxidase

PF00141 peroxidase 11-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804752.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	11	217	1.2e-50	173.2	Peroxidase
`XP_057804753.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	11	216	2.3e-48	165.8	Peroxidase
`XP_057804754.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	11	203	3.8e-40	138.9	Peroxidase
`XP_057804756.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	11	202	7.2e-38	131.4	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948773.1
CAAAAACAATTTAAGAAGGGAGTCATACAAAATCTTGATATTGATTGATTTAAGTTGAATTGAGCAATGGCAGATGGTAAAGAGATGGAGAGGGCGCGGAGGGATCTAAGAGCCCTCATCTCTTCCAAGAATTGTGCCCCCATCATGCTTCGCTTGGCGTGGCACGATGCAGGCACATATGATGCAAAAACAAAGACTGGAGGACCCAATGGTTCAATCAGGAACCAAGCTGAGCTCAATCATGCAGCCAATACTGGTCT...

XM_057948770.1
CAAAAACAATTTAAGAAGGGAGTCATACAAAATCTTGATATTGATTGATTTAAGTTGAATTGAGCAATGGCAGATGGTAAAGAGATGGAGAGGGCGCGGAGGGATCTAAGAGCCCTCATCTCTTCCAAGAATTGTGCCCCCATCATGCTTCGCTTGGCGTGGCACGATGCAGGCACATATGATGCAAAAACAAAGACTGGAGGACCCAATGGTTCAATCAGGAACCAAGCTGAGCTCAATCATGCAGCCAATACTGGTCT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131020103
ATGGCAGATGGTAAAGAGATGGAGAGGGCGCGGAGGGATCTAAGAGCCCTCATCTCTTCCAAGAATTGTGCCCCCATCATGCTTCGCTTGGCGTGGCACGATGCAGGCACATATGATGCAAAAACAAAGACTGGAGGACCCAATGGTTCAATCAGGAACCAAGCTGAGCTCAATCATGCAGCCAATACTGGTCTCAAAATTGCCATTGATCTTTGTGAAGTAAAAGCTAAACACCCGCGAGTTTCATATGCAGATCTTTA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057804752.1
MADGKEMERARRDLRALISSKNCAPIMLRLAWHDAGTYDAKTKTGGPNGSIRNQAELNHAANTGLKIAIDLCEEVKAKHPRVSYADLYQLAGVVAVEVTGGPTIDFDGGRKDSMASPEEGRLPDAKQGASHLRNVFNRMGLSDQDIVALSGGHTLGRAHAERSGFQGPWTRDPLKFDNSYFLELLRGDSTGLLKLPTDKVLVEDPQFRKFVTLYAEDEEAFFRDYAASHKRLSELGFSPPSSLRLAMKKTMIAAVVAVTV...

XP_057804753.1
MADGKEMERARRDLRALISSKNCAPIMLRLAWHDAGTYDAKTKTGGPNGSIRNQAELNHAANTGLKIAIDLCEVKAKHPRVSYADLYQLAGVVAVEVTGGPTIDFDGGRKDSMASPEEGRLPDAKQGASHLRNVFNRMGLSDQDIVALSGGHTLGRAHAERSGFQGPWTRDPLKFDNSYFLELLRGDSTGLLKLPTDKVLVEDPQFRKFVTLYAEDEEAFFRDYAASHKRLSELGFSPPSSLRLAMKKTMIAAVVAVTVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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