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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003206`

染色体: Chr04 坐标: 48902219-48904552 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003206`
名称	SmilChr04G003206
描述	NEP1-interacting protein-like 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48902219 - 48904552 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021148`
GeneID	`131021148`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021148`
原始查询	`SmilChr04G003206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NEP1-interacting protein-like 1
产物	NEP1-interacting protein-like 1
Arabidopsis	`AT4G35840` (AT4G35840) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829738] identity=71.7; qcov=0.972; evalue=1.34e-122; confidence=high
Rice	`Os10g0544600` - identity=58.5; qcov=0.83; evalue=1.05e-88; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021148

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057806222.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057806222.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806222.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806222.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806222.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48902563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr4:48903241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806222.1

247 aa

124

247

zf-RING_2

zf-RING_11

PF13639 zf-RING_2 201-244 aa PF17123 zf-RING_11 202-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806222.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	201	244	8.5e-13	49.1	Ring finger domain
`XP_057806222.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	202	230	1e-08	35.4	RING-like zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950239.1
ATTTTGTTTTGAAAGCATAGACACATTAATATGCGACAATAAAGCATGCGAGAATTGGAGCTGAGCATATAATAATAGAAAATAGGATTCCCAGAGCGTAAAGATATTTCCAAATTGGTAAATTGAATTTAATAATAGAGAGATGTTATTGCAAAGAAGAAGGCGAGCTATCACTAATCACCCACCGGTGACAAACTAATATATTTACATTTATTTATATATTATTATTATTATATACGTATGTGTGTATATATTTCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021148
ATGGAGTTTTACACATACCCATCTCATCATTTTCCCCCATCATCATCGCCATCATCGTCGTCATCATCATCAGAGACGTATTCTTCATTCGGATTTCTAGTCAATAAGATCAAAGATTTCATTCGATGCGCGGTTTCTGCTGTCGTGGGGAACGTTTTCTCCGCAATTTTTACATTTTTCTTCGCTTTGATTGGAACTCTACTTGGAGCAATTACAGGAGCTTTGATCGGCCAAGAGACGGAAAGTGGGTTTATTAGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806222.1
MEFYTYPSHHFPPSSSPSSSSSSSETYSSFGFLVNKIKDFIRCAVSAVVGNVFSAIFTFFFALIGTLLGAITGALIGQETESGFIRGASVGAISGAVFSIEVFESSLLLWQSDESGLGCLLYLIDVIASLLSGRLVRERIGPAMLSAVQSQMGAVEAPFEEVPNIFDTGGAKGLLVDMVEKIPKFTITGDESADTSGDGVSCSVCLQDFQLGETVRRLPHCHHMFHLPCIDTWLVRHGSCPLCRRDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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