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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003209`

染色体: Chr04 坐标: 48941580-48946053 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003209`
名称	SmilChr04G003209
描述	thiol-disulfide oxidoreductase LTO1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48941580 - 48946053 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020106`
GeneID	`131020106`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020106`
原始查询	`SmilChr04G003209`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thiol-disulfide oxidoreductase LTO1-like
产物	thiol-disulfide oxidoreductase LTO1-like
Arabidopsis	`AT4G35760` (LTO1) NAD(P)H dehydrogenase (quinone)s [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829729] identity=63.3; qcov=0.748; evalue=6.32e-129; confidence=high
Rice	`Os03g0131500` - identity=53; qcov=0.855; evalue=9.54e-115; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07884 (VKOR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020106

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804760.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057804760.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057804760.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057804760.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48942391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B88
`Chr4:48942396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:48942402`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr4:48942402`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr4:48942423`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	169	A1,A10,A11,A13,A18,A2,A20,A22,A23,A24,A4,A6,A8,A9,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B110,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B123,B124,B125,B127,B13,B131,B133,B135,B139,B140,B15,B17,B18,B19,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B34,B36,B37,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B6,B60,B64,B65,B66,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B79,B80,B81,B82,B84,B85,B87,B88,B90,B92,B93,B96,B97,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C20,C21,C23,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C85,C87,C9,D1,D11,D3,D4,D6,D7,D8
`Chr4:48942428`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr4:48942428`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr4:48943274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B88
`Chr4:48944144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804760.1

398 aa

199

398

VKOR

PF07884 VKOR 102-232 aa

XP_057804761.1

393 aa

196

393

VKOR

PF07884 VKOR 102-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804760.1`	Pfam	`PF07884`	VKOR	Domain	102	232	6.1e-29	101.6	Vitamin K epoxide reductase family
`XP_057804761.1`	Pfam	`PF07884`	VKOR	Domain	102	232	6.2e-29	101.5	Vitamin K epoxide reductase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948778.1
CTTTTATTGTGGAGGGAGTAAGTGAATGAGCGAGTAGTGAGAGACAGTTGAGTTCCTGACCCAACTAATCTTAATTAGTCACACTTTCTTGTAAACCACGGATCCGCCTAGTCAGATTCGCCGTCATTAACCGCGCTACAACCACCGCCATACAACGGCTTCGCGCTTTCCCACCGCCGCACAACTACTGCGTCCCACAGCATCAGCGGCGCGAGCTCATGGCGGCCAAGGCGTCGACCAGTTTCTTCAGCATATTATCA...

XM_057948777.1
AGGGAGTAAGTGAATGAGCGAGTAGTGAGAGACAGTTGAGTTCCTGACCCAACTAATCTTAATTAGTCACACTTTCTTGTAAACCACGGATCCGCCTAGTCAGATTCGCCGTCATTAACCGCGCTACAACCACCGCCATACAACGGCTTCGCGCTTTCCCACCGCCGCACAACTACTGCGTCCCACAGCATCAGCGGCGCGAGCTCATGGCGGCCAAGGCGTCGACCAGTTTCTTCAGCATATTATCATCTCCATCATCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020106
ATGGCGGCCAAGGCGTCGACCAGTTTCTTCAGCATATTATCATCTCCATCATCTTCTTCTTCTCTGTTTTTCCATCGGACTCCATTTCTCTGTCCGGCTTCACTCTCAGCTACTTCGCTTCCCAAATTCAAGGAAAGAATTCCGGGGCTAGGGCACGTGTTGGTTACGGTGAATTGCGTGTCGGAGCGTAGCAAACAGGCTGCGGAACCGGAGCCTGAAATAGCTCCCTCGCCGTCGTCGGAATCTCCATCGTCTTCTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804760.1
MAAKASTSFFSILSSPSSSSSLFFHRTPFLCPASLSATSLPKFKERIPGLGHVLVTVNCVSERSKQAAEPEPEIAPSPSSESPSSSSVAGADNDADISAYKWIVALGGIGLLETAYLTYLKLTGSDAFCPTGGGSCTTILTSDYSSVFGVPLPLFGMLAYGLVASLGLQLGTEKRTFDTGKSNGEIILVGITTSMAVASAYFLYILSTEFSGESCLYCLASATLSFSLFFITLKRFGLQEIQKILGLQLFVASLVVIALT...

XP_057804761.1
MAAKASTSFFSILSSPSSSSSLFFHRTPFLCPASLSATSLPKFKERIPGLGHVLVTVNCVSERSKQAAEPEPEIAPSPSSESPSSSSVAGADNDADISAYKWIVALGGIGLLETAYLTYLKLTGSDAFCPTGGGSCTTILTSDYSSVFGVPLPLFGMLAYGLVASLGLQLGTEKRTFDTGKSNGEIILVGITTSMAVASAYFLYILSTEFSGESCLYCLASATLSFSLFFITLKRFGLQEIQKILGLQLFVASLVVIALT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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