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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003214`

染色体: Chr04 坐标: 48967061-48969967 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003214`
名称	SmilChr04G003214
描述	serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48967061 - 48969967 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020112`
GeneID	`131020112`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020112`
原始查询	`SmilChr04G003214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like
产物	serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like
Arabidopsis	`AT4G35785` (AT4G35785) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829732] identity=82.5; qcov=0.477; evalue=1.53e-54; confidence=medium
Rice	`Os06g0724600` (P0535F09.37-1) - identity=50.6; qcov=1.18; evalue=8.01e-56; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0048026 (positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020112

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804769.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057804769.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057804769.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804769.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804769.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804769.1

234 aa

117

234

RRM_1

PF00076 RRM_1 67-136 aa

XP_057804770.1

216 aa

108

216

RRM_1

PF00076 RRM_1 49-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804769.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	67	136	3.4e-18	66.0	RNA recognition motif
`XP_057804770.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	49	118	2.9e-18	66.2	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948786.1
GTGGCGTGGCAGTGGCCAACCGGATGATTTTGTTTGGCAAGTGGGAACTCGCCTATTTCTAGATCTCTATATAATTAATAAATAAACAAAATTTCATAAGACGAGCTCAAAATTAGCTTTCGAAATAAGCGACTGGGTTTAGGGTTTCGTCGTCTCTGCTCCTACTATGGCTGATTCTCCAAGAAAACGGTATGCACGCTCTCCCTCTCCATGGGAAGAAAATTCGAGATCCAGGTCAAGATCTAGGTCCAAATCTAGAT...

XM_057948787.1
AGTGGGAACTCGCCTATTTCTAGATCTCTATATAATTAATAAATAAACAAAATTTCATAAGACGAGCTCAAAATTAGCTTTCGAAATAAGCGACTGGGTTTAGGGTTTCGTCGTCTCTGCTCCTACTATGGCTGATTCTCCAAGAAAACGGTATGCACGCTCTCCCTCTCCATGGGAAGAAAATTCGAGATCCAGGTCAAGATCTAGATCAAGATCTAGGTCAAGAGGTCGTGGCACTGGCAGGGAAGAAGTTGTTAATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020112
ATGGCTGATTCTCCAAGAAAACGGTATGCACGCTCTCCCTCTCCATGGGAAGAAAATTCGAGATCCAGGTCAAGATCTAGGTCCAAATCTAGATCTCGTTCTAGATCATGGTCAAGACCAAGGGCGAGATCTAGATCAAGATCTAGGTCAAGAGGTCGTGGCACTGGCAGGGAAGAAGTTGTTAATGATGGAACTACACTTTATGTTACTGGCCTATCTACAAGGGTCACTGAGAGAGAGCTTGAAGATCATTTCTCAAA...

LOC131020112
ATGGCTGATTCTCCAAGAAAACGGTATGCACGCTCTCCCTCTCCATGGGAAGAAAATTCGAGATCCAGGTCAAGATCTAGATCAAGATCTAGGTCAAGAGGTCGTGGCACTGGCAGGGAAGAAGTTGTTAATGATGGAACTACACTTTATGTTACTGGCCTATCTACAAGGGTCACTGAGAGAGAGCTTGAAGATCATTTCTCAAAGGAAGGAAAGGTCAAGTCTGTCTTTTTGGTTGTGGAACCGCGATCTCGTGTATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804769.1
MADSPRKRYARSPSPWEENSRSRSRSRSKSRSRSRSWSRPRARSRSRSRSRGRGTGREEVVNDGTTLYVTGLSTRVTERELEDHFSKEGKVKSVFLVVEPRSRVSRGFAFVNMDSSDDANRCIKHLNQSVLEGRYITVERSRRKRARTPTPGHYLGLKSSRGDGYGDRGRYRGGSSREDYGYRRSPRRSPYRGGRDYSPRHSPYGGSGRSRRERSRSYSPPRHSLERNYARGSR

XP_057804770.1
MADSPRKRYARSPSPWEENSRSRSRSRSRSRSRGRGTGREEVVNDGTTLYVTGLSTRVTERELEDHFSKEGKVKSVFLVVEPRSRVSRGFAFVNMDSSDDANRCIKHLNQSVLEGRYITVERSRRKRARTPTPGHYLGLKSSRGDGYGDRGRYRGGSSREDYGYRRSPRRSPYRGGRDYSPRHSPYGGSGRSRRERSRSYSPPRHSLERNYARGSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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