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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003232`

染色体: Chr04 坐标: 49146843-49148469 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003232`
名称	SmilChr04G003232
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49146843 - 49148469 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020132`
GeneID	`131020132`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020132`
原始查询	`SmilChr04G003232`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
产物	loganic acid O-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G68040` (AT1G68040) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843132] identity=39; qcov=1.04; evalue=8.72e-84; confidence=medium
Rice	`Os04g0665200` (IAMT1) - identity=35.3; qcov=1.07; evalue=7.37e-62; confidence=medium
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020132

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804794.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804794.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804794.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804794.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804794.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49146965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B65,B98,C53,D4
`Chr4:49147039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B84
`Chr4:49147102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr4:49147166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C15
`Chr4:49147310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C44,C80
`Chr4:49147311`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B10
`Chr4:49147311`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B10
`Chr4:49147420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C8
`Chr4:49147553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,C14,C73,C87
`Chr4:49147559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:49147592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C73
`Chr4:49147652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804794.1

339 aa

170

339

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 4-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804794.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	4	339	9.6e-104	347.9	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948811.1
AATCAGCCATAGCATAATTTTACATCATCAATAAAAATAGAAAAGAAAAAAAAAGCTCAATATAGAGAGAGAGGCAATGGGGGAAACCTTCCCAATGAAAGGTGGAGATGATGCCCACAGCTACTCCAAAAACTCCCGCTATCAGAAATTAGCTTCTGACACCGTCAAGGAAATGATCCAAGAGGCAGTGAGTGAGTATCTAGCCACAGAATCAATGTCGAGCAGAGTGACAATAGCAGACTTGGGGTGTTCCGTCGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020132
ATGGGGGAAACCTTCCCAATGAAAGGTGGAGATGATGCCCACAGCTACTCCAAAAACTCCCGCTATCAGAAATTAGCTTCTGACACCGTCAAGGAAATGATCCAAGAGGCAGTGAGTGAGTATCTAGCCACAGAATCAATGTCGAGCAGAGTGACAATAGCAGACTTGGGGTGTTCCGTCGGCTTAAACACATTCTTTGCAGTTCAAAATCTGATGGAAGCAGTTGAAGCCAAGTGGTCTTCCAAAAACAAGCTGGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804794.1
MGETFPMKGGDDAHSYSKNSRYQKLASDTVKEMIQEAVSEYLATESMSSRVTIADLGCSVGLNTFFAVQNLMEAVEAKWSSKNKLEFQVFFNDHSANDFNTLFTSLPPDRQYHAAGVPGSFHGRLFPCNSITVAYSSQSLHWLSKQPQGLHNEGRIHGSGAPEHVARAYSDQFEKDLGDFMSARAEEIVSGGLMFLLMPGTPEGVPQTELSAIFDYYGYTLMDLAKEGVVEKSAIDAFNLPIHIPTLEEMRKVIEKNGHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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