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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003235`

染色体: Chr04 坐标: 49165910-49168531 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003235`
名称	SmilChr04G003235
描述	UV-B-induced protein At3g17800, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49165910 - 49168531 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020136`
GeneID	`131020136`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020136`
原始查询	`SmilChr04G003235`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UV-B-induced protein At3g17800, chloroplastic-like
产物	UV-B-induced protein At3g17800%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G48450` (AT1G48450) alanine-tRNA ligase, putative (DUF760) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841266] identity=65.6; qcov=0.866; evalue=6.02e-166; confidence=high
Rice	`Os03g0717900` - identity=66.1; qcov=0.816; evalue=1.78e-150; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05542 (DUF760)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020136

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804802.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057804802.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804802.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804802.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804802.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49166277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B83
`Chr4:49167034`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr4:49167034`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr4:49167063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B45,B97
`Chr4:49167507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804802.1

419 aa

210

419

DUF760

PF05542 DUF760 141-266 aa

XP_057804803.1

419 aa

210

419

DUF760

PF05542 DUF760 141-266 aa

XP_057804805.1

419 aa

210

419

DUF760

PF05542 DUF760 141-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804802.1`	Pfam	`PF05542`	DUF760	Family	141	266	1.1e-27	96.9	Protein of unknown function (DUF760)
`XP_057804803.1`	Pfam	`PF05542`	DUF760	Family	141	266	1.1e-27	96.9	Protein of unknown function (DUF760)
`XP_057804805.1`	Pfam	`PF05542`	DUF760	Family	141	266	1.1e-27	96.9	Protein of unknown function (DUF760)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948819.1
AAAAAACACGGGATTCCCAATCCATTCCCACAGGGCACCGCACAGCACTCCGTTTCGAAACGAGCGACGAATAAATCAATTAAAAATATACATTTTCTCAGTCAACATTAGCGAGCAGCTAGGGATAACTCATCTAGTTGCCACTACTGATTCAGGATGGAAACAGTAGCTGCTTTTCGGGCTTCTATTTGCAGTATTTCTCCCAATTGGGCATCCCGGTCCGGCCCGGCCAGACCCGATCTCAGGATCGGGTCGAGGCC...

XM_057948820.1
CACCGCACAGCACTCCGTTTCGAAACGAGCGACGAATAAATCAATTAAAAATATACATTTTCTCAGTCAACATTAGCGAGCAGCTAGGGATAACTCATCTAGGATGGAAACAGTAGCTGCTTTTCGGGCTTCTATTTGCAGTATTTCTCCCAATTGGGCATCCCGGTCCGGCCCGGCCAGACCCGATCTCAGGATCGGGTCGAGGCCCGTGCTCTCTAACGCTTCGATTCAGCAAACACCACTGGTTTCTAAATTCAAGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020136
ATGGAAACAGTAGCTGCTTTTCGGGCTTCTATTTGCAGTATTTCTCCCAATTGGGCATCCCGGTCCGGCCCGGCCAGACCCGATCTCAGGATCGGGTCGAGGCCCGTGCTCTCTAACGCTTCGATTCAGCAAACACCACTGGTTTCTAAATTCAAGATAGGAAACAAAAAGGCGAGCCATTTGAGCAGGAAGCGTACTGCAACCAGAGCTTCTATGCAACCTTCCGACTCTGACAGTTCAGAAGCTCCTATTGCTCCTCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804802.1
METVAAFRASICSISPNWASRSGPARPDLRIGSRPVLSNASIQQTPLVSKFKIGNKKASHLSRKRTATRASMQPSDSDSSEAPIAPLQMESPIGQFLSEILASHPHLVPAAVEQQLEQLQTDREAEKEKEEPSASGTDLVLYRRIAEVKANERRKTLEEILYALVVQKFMDASVSLIPTITPSTPDGPARVDVWPSQDDKLERIHSPEAYEMIQNHLSLILGNRLGDSNSVAQISKLRVGQVYAASVMYGYFLKRVDQRF...

XP_057804803.1
METVAAFRASICSISPNWASRSGPARPDLRIGSRPVLSNASIQQTPLVSKFKIGNKKASHLSRKRTATRASMQPSDSDSSEAPIAPLQMESPIGQFLSEILASHPHLVPAAVEQQLEQLQTDREAEKEKEEPSASGTDLVLYRRIAEVKANERRKTLEEILYALVVQKFMDASVSLIPTITPSTPDGPARVDVWPSQDDKLERIHSPEAYEMIQNHLSLILGNRLGDSNSVAQISKLRVGQVYAASVMYGYFLKRVDQRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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