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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003239`

染色体: Chr04 坐标: 49176806-49179345 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003239`
名称	SmilChr04G003239
描述	purple acid phosphatase 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49176806 - 49179345 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020141`
GeneID	`131020141`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020141`
原始查询	`SmilChr04G003239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	purple acid phosphatase 3-like
产物	purple acid phosphatase 3-like
Arabidopsis	`AT1G14700` (PAP3) purple acid phosphatase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838035] identity=57.2; qcov=0.923; evalue=1.43e-129; confidence=high
Rice	`Os03g0238600` (OsPAP3c) - identity=56.1; qcov=0.893; evalue=3.93e-122; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0008199 (ferric iron binding)
KEGG	smil00740 (Riboflavin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020141

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057804810.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057804810.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804810.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804810.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804810.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49177135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C78
`Chr4:49177718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B30
`Chr4:49177916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B26,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804810.1

337 aa

168

337

Metallophos

PF00149 Metallophos 47-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804810.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	47	255	6.3e-20	73.2	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948827.1
GAAAAAATTAATGAGAAACCATACGATGGAAAACCAGCAAAAGTAATAGCGTTACGTAAAAAGTGGGGCGGAAGATTTAAAATTTGAAAGGGTGAAGTAATCCACGTATGAGTGCCCATATGCACCTCATAAATCTCAAATTACACAACATTTTCATATATTTTGAGGCCTCGATTATCTACAGAATTTGGGCATGCACGTAGCTCAGCAGAAACGTATATCCCAACACCTATTGCTTTTTTTTTTTTCAAAAATTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020141
ATGTCTCATTTGTTCTATAACTCCTTATTGATATGGCCACTATTGCTGATGACGTCCTTCTCTCTGAAACTTCCAAGCAAAGCTGTAGAACTTTCCAGAATCCAGCATCTGAGCAAGAGAGACGACCATTCTATCGCATTTTTGGCTGTGGGAGATTGGGGAAGAGATGGGAATTTCAACCAATCTAGAGTTGCTACTCAGATGGGATATGTTGGAAAGAAACTGGGAATCGATTTTGTGATCTCCACCGGTGATAACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804810.1
MSHLFYNSLLIWPLLLMTSFSLKLPSKAVELSRIQHLSKRDDHSIAFLAVGDWGRDGNFNQSRVATQMGYVGKKLGIDFVISTGDNFYTKGLKGVDDRAFQTSFTNIYTAKSLRKPWYSVLGNHDYQGNVEAQLSPALKKLDRRWNCKRNFIVEAGAADIFFVDTTPFVQKYFDNPKKQEFDWRNVFPRERYLSSTLKNLNLSLENSKARWKIVVGHHTIRSIGYHGDTQEMLDHFLPVLEAQKVDMYINGHDHCLQHLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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