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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003257`

染色体: Chr04 坐标: 49300848-49304424 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003257`
名称	SmilChr04G003257
描述	uncharacterized SmilChr04G003257
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49300848 - 49304424 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020160`
GeneID	`131020160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020160`
原始查询	`SmilChr04G003257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0359000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os05g0359000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=22.5; qcov=0.64; evalue=1.07e-09; confidence=weak
Rice	`Os05g0359000` - identity=28.1; qcov=0.679; evalue=9.28e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804832.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804832.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804832.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804832.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49304204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A10,A8,B100,B105,B118,B12,B122,B136,B14,B19,B27,B36,B41,B6,B70,B76,B79,B84,B97,C13,C21,C26,C35,C42,C47,C5,C52,C53,C56,C61,C67,C7,C79,C81,C84,C87,D8
`Chr4:49304266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C10
`Chr4:49304268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C65
`Chr4:49304280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C6,C64,C66
`Chr4:49304289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C55,C60,C77
`Chr4:49304330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B139,B4,B76,D10
`Chr4:49304336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B140,B17,B21,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804832.1

445 aa

222

445

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 152-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804832.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	152	280	2.1e-13	51.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948849.1
AAGGAAAGTTGAGATCTAGCTGCTAGACTCAGGGAGAAGCTCCAAACTGTAGAACAGGACTAGGATTTCAATGGATAATGATCCTTGTGCCCCGGCACCTTCTACAAATACAAATACAACTTCAACAAGTAGAGCCAAAAGGGGGAAAGTATGTCTGACGAAAGTTGCTCAGCGGAGGGCAAAAGGGGTCATCCAACATGTTGATTTCAACGCACGTGGACAGCCAGTGGGTGAGGCAGCAGCTGAAATGCAAAGTTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020160
ATGGATAATGATCCTTGTGCCCCGGCACCTTCTACAAATACAAATACAACTTCAACAAGTAGAGCCAAAAGGGGGAAAGTATGTCTGACGAAAGTTGCTCAGCGGAGGGCAAAAGGGGTCATCCAACATGTTGATTTCAACGCACGTGGACAGCCAGTGGGTGAGGCAGCAGCTGAAATGCAAAGTTACATTGGCCTCCTTACACGTGATCACGTGAAGATAAACATTAAGAAGTGGAAAGCTGTCCCGCAAGATGTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804832.1
MDNDPCAPAPSTNTNTTSTSRAKRGKVCLTKVAQRRAKGVIQHVDFNARGQPVGEAAAEMQSYIGLLTRDHVKINIKKWKAVPQDVKDLIWDTVKSSYDVPEQWKAGCMESANAKWRSWKCRMYNEFIVPCQDDASKLQEPPPGSGILPLEWNQFVVTRLSTEFKNFSAQQKERRSKNIYPHRLSRKGYAKFAEELKTSDLHGDEDIDRATMWKKARLTKDGEVQNDNLKNAFQKIDDCIREKEEGRVDSSSCSSDLLSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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