当前解析结果
SmilChr04G003271| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003271 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003271 |
| 描述 | thylakoid lumenal 17.9 kDa protein, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 49406301 - 49408396 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020174 |
|---|---|
| GeneID | 131020174 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020174 |
| 原始查询 | SmilChr04G003271 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | thylakoid lumenal 17.9 kDa protein, chloroplastic |
| 产物 | thylakoid lumenal 17.9 kDa protein%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT4G24930 (AT4G24930)thylakoid lumenal 17.9 kDa protein, chloroplast [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828595] identity=59; qcov=0.833; evalue=5.7e-75; confidence=high |
| Rice | Os01g0102300 (OsTLP27)- identity=51.3; qcov=0.65; evalue=3.15e-43; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020174 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057804845.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057804845.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.40000 | XP_057804845.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057804845.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804845.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:49406589 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,C42,C60,D2 |
Chr4:49407786 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A6,B45,B97,C86 |
Chr4:49407869 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。