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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003272`

染色体: Chr04 坐标: 49408743-49410901 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003272`
名称	SmilChr04G003272
描述	non-specific phospholipase C6
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49408743 - 49410901 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020173`
GeneID	`131020173`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020173`
原始查询	`SmilChr04G003272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific phospholipase C6
产物	non-specific phospholipase C6
Arabidopsis	`AT3G48610` (NPC6) non-specific phospholipase C6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824021] identity=74.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0826600` (NPC1) - identity=58.6; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009395 (phospholipid catabolic process); GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00565 (Ether lipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04185 (Phosphoesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020173

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057804844.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804844.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804844.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804844.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49408964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:49409010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:49409037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C32,C68
`Chr4:49409101`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A13,A18,B125,B131,B27,B57,B77,B88,C44,C50
`Chr4:49409129`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr4:49409129`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr4:49409222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C66
`Chr4:49409302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:49409373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr4:49409374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C37
`Chr4:49409614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:49409672`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	43	A15,A21,B100,B102,B112,B113,B115,B119,B122,B130,B136,B137,B139,B140,B15,B18,B36,B47,B60,B62,B67,B73,B77,B88,B92,B94,C12,C14,C2,C39,C5,C55,C57,C6,C66,C68,C72,C77,C8,C84,C87,C9,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804844.1

505 aa

252

505

Phosphoesterase

PF04185 Phosphoesterase 26-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804844.1`	Pfam	`PF04185`	Phosphoesterase	Family	26	379	1.5e-104	350.7	Phosphoesterase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948861.1
CCCTTAGTTTTGGAATATTTAGATTTCATTTTATAATGCACGCACACAGAAATCTTCATCCACATTCCTACTCATTCGCTACATACATTTATATATTTACGTTTTTGTAAGATCGAATTTGGAATCTAGCAGATATTCACGTGATTCCACTTCACTCTCTATACCTATCAAGATTGCCGTAATCTCTTCTCTTAACTGTAACCTGTCAAGTGTGAACTCACTCACTCACTCAGTCTCTCACACAAACAAGATTCATTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020173
ATGAGAGGCGTTTTCCTGAATTTCCTCATACTCTCCTCCATTTTCCAGCAATCCCTAGAGCAGCAGCAGCAGCCAATCAAAACTGTGGTGGTTTTGGTGTTGGAGAATCGGTCATTCGATCACATGCTGGGATGGATGAAGCAATCCATCAACCCCTCAATCAACGGCGTCACCGGGCGTGAATGCAACGCCGTCTCAACCAATTCCACCGACATAATCTGCTTCTCCGACGACGCCGAGTTCGTGGATCCGGACCCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804844.1
MRGVFLNFLILSSIFQQSLEQQQQPIKTVVVLVLENRSFDHMLGWMKQSINPSINGVTGRECNAVSTNSTDIICFSDDAEFVDPDPGHSFEDVAKQVFGSASVPSMSGFAEQASTIAQNLSHTVMKGFRPENVPIYAELVKEFAVFDRWFSSIPGPTQPNRLFAYSATSHGSTSHVKRQLASGYPQQTIFESLREDRFDFGIYFQNIPTTLFYRNLRKLKYVSKFHDFDLRFKRDARAGKLPNLCVIEPRYFDIIGFPAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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