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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003279`

染色体: Chr04 坐标: 49467302-49469038 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003279`
名称	SmilChr04G003279
描述	uncharacterized SmilChr04G003279
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49467302 - 49469038 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020177`
GeneID	`131020177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020177`
原始查询	`SmilChr04G003279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0487100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0487100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G23520` (AT2G23520) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816884] identity=28.3; qcov=0.633; evalue=3.82e-22; confidence=low
Rice	`Os11g0487100` - identity=55.8; qcov=0.944; evalue=1.79e-120; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804850.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804850.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057804850.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804850.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804850.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49468009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C40
`Chr4:49468223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C10
`Chr4:49468338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:49468524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:49468624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:49468642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:49468791`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr4:49468791`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948869.1
GCTACATTTTGTTGCCACTCTTCATATCTTGCTCTTGACTTACTCTGCAACACCATCCATCATCTATCGTTGCATCTCCCATATTTCCAGCCCTCTTTGTTGTTGACGATGATTTTATCAAAATAGAGCAGCATCTTCTGGAAAGATCAGCCACAACCATGGAAAAGAATAACGAGAAACATGCAGTTATATCTCCAGGAATCAAGGTAGCCAAAGATGAAGACATGAGAAAATCCTTATTCAGTGCAGCAAAATCACCA...

XM_057948867.1
ATTTTGTTGCCACTCTTCATATCTTGCTCTTGACTTACTCTGCAACACCATCCATCATCTATCGTTGCATCTCCCATATTTCCAGCCCTCTTTGTTGTTGACGATGATTTTATCAAAATAGAGCAGCATCTTCTTTTATGGGCAGGGAAAGATCAGCCACAACCATGGAAAAGAATAACGAGAAACATGCAGTTATATCTCCAGGAATCAAGGTAGCCAAAGATGAAGACATGAGAAAATCCTTATTCAGTGCAGCAAAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020177
ATGGGCAGGGAAAGATCAGCCACAACCATGGAAAAGAATAACGAGAAACATGCAGTTATATCTCCAGGAATCAAGGTAGCCAAAGATGAAGACATGAGAAAATCCTTATTCAGTGCAGCAAAATCACCAACTGAAAGTGGCAGACCAAGCAGCATGGTTTTTAAGAAAGCTCATAGAGTAATACCGGCTCATATAGTTGCTGAAGCCATATCCACGCTCCACGGTCTGGACCTCAGGTGGTCAGGACCGATAACTCCGAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804850.1
MGRERSATTMEKNNEKHAVISPGIKVAKDEDMRKSLFSAAKSPTESGRPSSMVFKKAHRVIPAHIVAEAISTLHGLDLRWSGPITPSEMQYVEQYVVAKYPEYSNALVEGGEKTDLYDLCVTEKLEEPQPDDKRKSPRGFSRDTFGSSLPDLENTQLEPSRLLSILTKKSSFVGSFVSIPEIQARNKVLKHCGLPDEEYLVLFTQNYKDAMMLVGESYPFFKGNYYLTIIGEEADYVKEFATYKESRVIAAPESWLDLRI...

XP_057804851.1
MGRERSATTMEKNNEKHAVISPGIKVAKDEDMRKSLFSAAKSPTESGRPSSMVFKKAHRVIPAHIVAEAISTLHGLDLRWSGPITPSEMQYVEQYVVAKYPEYSNALVEGGEKTDLYDLCVTEKLEEPQPDDKRKSPRGFSRDTFGSSLPDLENTQLEPSRLLSILTKKSSFVGSFVSIPEIQARNKVLKHCGLPDEEYLVLFTQNYKDAMMLVGESYPFFKGNYYLTIIGEEADYVKEFATYKESRVIAAPESWLDLRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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