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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003282`

染色体: Chr04 坐标: 49496158-49498946 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003282`
名称	SmilChr04G003282
描述	protein TAPETUM DETERMINANT 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49496158 - 49498946 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020181`
GeneID	`131020181`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020181`
原始查询	`SmilChr04G003282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TAPETUM DETERMINANT 1-like
产物	protein TAPETUM DETERMINANT 1-like
Arabidopsis	`AT4G24972` (TPD1) tapetum determinant 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745725] identity=60.6; qcov=0.68; evalue=3.71e-53; confidence=high
Rice	`Os12g0472500` (OsTDL1A) - identity=52.7; qcov=0.577; evalue=8.94e-37; confidence=medium
GO	GO:0001709 (cell fate determination)
KEGG	-
Pfam	PF24068 (TPD1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020181

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057804855.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057804855.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057804855.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804855.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49496504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr4:49498270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B54,B63,C68
`Chr4:49498271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C68
`Chr4:49498358`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B132,B135,B21,B78,C56,C65,C73,C75,D2
`Chr4:49498359`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B132,B135,B21,B78,C56,C65,C73,C75,D2
`Chr4:49498482`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A15,B21,B58,B62,B66,B78,B94,C63,C64,C65,C73
`Chr4:49498485`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A15,B21,B58,B62,B66,B78,B94,C63,C64,C65,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804855.1

195 aa

195

TPD1_C

PF24068 TPD1_C 98-195 aa

XP_057804856.1

194 aa

194

TPD1_C

PF24068 TPD1_C 97-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804855.1`	Pfam	`PF24068`	TPD1_C	Domain	98	195	2.5e-41	140.3	Tapetum determinant 1, C-terminal
`XP_057804856.1`	Pfam	`PF24068`	TPD1_C	Domain	97	194	2.5e-41	140.3	Tapetum determinant 1, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948873.1
CACGCTTCTCGGAACTGATTGTTCACACTCGTCTCTCTCTAATCTCTATATCTCTCCCCCAAAAAACTCCAAAATCAAAGGTAAAAAGAGAGATATCAGAGTTGCATATAGCAGCTACCAGCTGATTCACAATTTCTGCTTCTCCTTGCGACCTGCTGATTCACAATTTCTGCTTCTCCTTTTTAGCCTCAGCTCTGCAATCTTTTTTCGTGCTTCCGTTCTGCTTTCGATGCTCTGTCGCTATGCTTGTGTATGTGTAT...

XM_057948872.1
ACGCTTCTCGGAACTGATTGTTCACACTCGTCTCTCTCTAATCTCTATATCTCTCCCCCAAAAAACTCCAAAATCAAAGGTAAAAAGAGAGATATCAGAGTTGCATATAGCAGCTACCAGCTGATTCACAATTTCTGCTTCTCCTTGCGACCTGCTGATTCACAATTTCTGCTTCTCCTTTTTAGCCTCAGCTCTGCAATCTTTTTTCGTGCTTCCGTTCTGCTTTCGATGCTCTGTCGCTATGCTTGTGTATGTGTATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020181
ATGAACCGCGAATCATTATCACCATTATTATGGCGCCGAAGGCTTTCTTCATTTACGGCGGTGTTTGCGGTCACATCCTTGTTACTAATCACCGGAATCTATACTGCAGATCAAGTATTGAAGGAGTTGGGATCAGTTTTAACCGAGAAGAAAAGCTCAACCTCAACCACCGGCCACAACAAGATTATCTCTGTGACTCATCGGAAACTGCTTAATACTGCAGCAGGAAAGCGAAAAGGACATGAGAGTGAAAAGGGTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804855.1
MNRESLSPLLWRRRLSSFTAVFAVTSLLLITGIYTADQVLKELGSVLTEKKSSTSTTGHNKIISVTHRKLLNTAAGKRKGHESEKGVEPNRIWSDKCSKSDIVISQGATEPLPNGIPTYTVEIINTCISGCDISAIHLSCGWFSSARLVNPHVFKRLRFDDCLLNDGKPLRNGRTLSFQYANTFRYALSVSSVSC

XP_057804856.1
MNRESLSPLLWRRRLSSFTAVFAVTSLLLITGIYTADQVLKELGSVLTEKKSSTSTTGHNKIISVTHRKLLNTAGKRKGHESEKGVEPNRIWSDKCSKSDIVISQGATEPLPNGIPTYTVEIINTCISGCDISAIHLSCGWFSSARLVNPHVFKRLRFDDCLLNDGKPLRNGRTLSFQYANTFRYALSVSSVSC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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