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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003297`

染色体: Chr04 坐标: 49687169-49687920 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003297`
名称	SmilChr04G003297
描述	uncharacterized SmilChr04G003297
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49687169 - 49687920 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020194`
GeneID	`131020194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020194`
原始查询	`SmilChr04G003297`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804869.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057804869.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804869.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804869.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49687208`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A14,A2,A21,A5,B105,B110,B12,B120,B124,B127,B128,B129,B131,B133,B135,B137,B139,B19,B26,B32,B40,B50,B55,B56,B60,B62,B63,B68,B70,B76,B85,B86,B87,B88,C11,C12,C21,C23,C28,C38,C48,C54,C60,C69,C71,C77,C78,C83,D3,D8
`Chr4:49687217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C82
`Chr4:49687235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B22,B64,C79
`Chr4:49687237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B76,C45
`Chr4:49687243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B53,B66,D2
`Chr4:49687567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr4:49687569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:49687571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C60
`Chr4:49687572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr4:49687573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr4:49687594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr4:49687646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948886.1
TCGAGAGCAGATGAGGTTGACAATTGGGCGTCGAACAAGAGTTTTGCCCCTTCTCCCTCTCTCTACCTCCTCTCTGCGCTGCCTTTGTCTCCGGCGAGCAGCCGCTAGCCGCCACCTTCTCCAGCCTGGCGTCGCCCTCCATCCCCATCACCTCTCTCTCGCTTCCACCACCACGAGCAACCTCCATCGTCGGCTCAGCGCCCACCACCGCTCCAATCGCACCACCACTACCCCTGGCACCTGCCTCCAGCCTCTGACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020194
ATGAGGTTGACAATTGGGCGTCGAACAAGAGTTTTGCCCCTTCTCCCTCTCTCTACCTCCTCTCTGCGCTGCCTTTGTCTCCGGCGAGCAGCCGCTAGCCGCCACCTTCTCCAGCCTGGCGTCGCCCTCCATCCCCATCACCTCTCTCTCGCTTCCACCACCACGAGCAACCTCCATCGTCGGCTCAGCGCCCACCACCGCTCCAATCGCACCACCACTACCCCTGGCACCTGCCTCCAGCCTCTGACTCCGACAACAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804869.1
MRLTIGRRTRVLPLLPLSTSSLRCLCLRRAAASRHLLQPGVALHPHHLSLASTTTSNLHRRLSAHHRSNRTTTTPGTCLQPLTPTTVALILQVVRSRRSVGITNLLLLLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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