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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003299`

染色体: Chr04 坐标: 49707774-49711492 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003299`
名称	SmilChr04G003299
描述	uncharacterized SmilChr04G003299
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49707774 - 49711492 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020197`
GeneID	`131020197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020197`
原始查询	`SmilChr04G003299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839276]; symbol=TPR2; hit=AT1G04130; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839276]; symbol=TPR2; hit=AT1G04130; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G04130` (TPR2) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839276] identity=62.8; qcov=0.992; evalue=1.67e-173; confidence=high
Rice	`Os03g0750100` - identity=48.4; qcov=0.689; evalue=8.55e-74; confidence=high
GO	GO:0051879 (Hsp90 protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF14559 (TPR_19); PF18972 (Wheel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804875.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804875.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057804875.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057804875.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49707931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B99,C40
`Chr4:49708688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:49709394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:49709720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:49709897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B21
`Chr4:49709897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr4:49710178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B63,C12,C37,C53
`Chr4:49711375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804875.1

363 aa

182

363

TPR_19

Wheel

PF14559 TPR_19 83-148 aa PF18972 Wheel 200-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804875.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	83	148	2.7e-06	28.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057804875.1`	Pfam	`PF18972`	Wheel	Domain	200	268	2e-13	51.4	Cns1/TTC4 Wheel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948892.1
TTCTGTTCAAAATCAACACTGTAGTCTGCCGCTGCTGCCTGCTTCTGATTTTCTACCAAGTCGTTCCAGAAAAATCTAGCTCAATATTTTGCTTGATTGAAAACCCATGGCTTTGTTGATGGATCCTGGCTCTGAACCCCAGACCAACGATGAGCTCATTGATCTTGAGGCTATTGCTGCGCTCAAAGAGTCCGCTGCTATTGAGCTCAAGGAACAGGGAAACGAGTATGTAAAAAAGGGAAAGAAGCATTACTCAGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020197
ATGGCTTTGTTGATGGATCCTGGCTCTGAACCCCAGACCAACGATGAGCTCATTGATCTTGAGGCTATTGCTGCGCTCAAAGAGTCCGCTGCTATTGAGCTCAAGGAACAGGGAAACGAGTATGTAAAAAAGGGAAAGAAGCATTACTCAGATGCTATTGATTGCTATACTAGAGCCATTAACCAGAAGGCCTTAAGTGATCCAGAGAACTCTATTCTTTATTCCAATAGGGCGCATGTGAATCTGCTCATGGGAAATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804875.1
MALLMDPGSEPQTNDELIDLEAIAALKESAAIELKEQGNEYVKKGKKHYSDAIDCYTRAINQKALSDPENSILYSNRAHVNLLMGNYRRSLQDAEEAIKLCPTNVKALYRAVKASLSLNLLDEARSYCEKGLQQYPDNEELKKLAKQIDVKKSEHERREAELSKAVAAAKDIVTALEDRRIKLGKAMYQELTGIKKPVLDNNKILHWPVVLLYAEVMSSDIIEDFCETDMFSVHLDMMFSDGSPPLPWDTDNAYSRDALE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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