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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003303`

染色体: Chr04 坐标: 49755086-49757179 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003303`
名称	SmilChr04G003303
描述	uncharacterized SmilChr04G003303
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49755086 - 49757179 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020202`
GeneID	`131020202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020202`
原始查询	`SmilChr04G003303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835162]; symbol=AT5G50900; hit=AT5G50900; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835162]; symbol=AT5G50900; hit=AT5G50900; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G50900` (AT5G50900) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835162] identity=55.6; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0522601` - identity=37.2; qcov=0.936; evalue=2.34e-87; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF23005 (DUF7032)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804879.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057804879.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804879.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804879.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49755400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:49755759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B35
`Chr4:49755951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr4:49755966`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A18,B1,B100,B103,B108,B118,B121,B126,B13,B134,B139,B15,B17,B27,B29,B37,B41,B5,B51,B52,B57,B64,B77,B84,B91,B93,C1,C12,C15,C24,C30,C38,C49,C51,C56,C60,C70,C77,C83,C85,D1,D11,D2
`Chr4:49755971`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A18,B1,B100,B103,B108,B118,B121,B126,B13,B134,B139,B15,B17,B27,B29,B37,B41,B5,B51,B52,B57,B64,B77,B84,B91,B93,C1,C12,C15,C24,C30,C38,C49,C51,C56,C60,C70,C77,C83,C85,D1,D11,D2
`Chr4:49756095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C27
`Chr4:49756108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B107,B99,C15,D9
`Chr4:49756116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D9
`Chr4:49756118`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A21,A25,B20,B44,B47,B5,B51,B71,B83,B86,B90,C21
`Chr4:49756127`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A21,A25,B125,B134,B137,B16,B20,B44,B47,B5,B51,B60,B71,B77,B83,B86,B90,C21
`Chr4:49756142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:49756201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804879.1

563 aa

282

563

DUF7032

PF23005 DUF7032 18-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804879.1`	Pfam	`PF23005`	DUF7032	Domain	18	129	7.5e-35	119.9	Domain of unknown function (DUF7032)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948896.1
GGTATGGCTTAAAATTACGTATTAGTTGAGTGATTATAATATAATAGTTGGTGAAAACCTAACAAATATAGGAATGATGAATAAATGATTTTGTTTTGAATATTCGAAATACGAAGTCCACGCTCTTCACCCAACAAGGCAACCCTTCCTCCGCCGCGCCGACGCCATGAAGGAAGCAGCCGAGGAAGAGCCCATCATCAATTCGGTCGTCGCGGACATACAGCAGCAGCTCCACTCCCTCCTAGATTCCGTCTCCAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020202
ATGAAGGAAGCAGCCGAGGAAGAGCCCATCATCAATTCGGTCGTCGCGGACATACAGCAGCAGCTCCACTCCCTCCTAGATTCCGTCTCCAGCGTCCAAATCCTCAAGGGCAAATGGTCGCTCATAACCACCAAGCTCACAACTTTACACAACCGCCTCTCCGACCTATCCAGTTCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCAATAACCCTCTCTCATCAGACCTCCTCCGCTCCATCTCCGCCACGTGCTCAGCCGCCGCCTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804879.1
MKEAAEEEPIINSVVADIQQQLHSLLDSVSSVQILKGKWSLITTKLTTLHNRLSDLSSSAASAAANNPLSSDLLRSISATCSAAASLSALCHSPTPPGGKLKTQNDIDSLSAKLDAHTNDLEVIVKSGVLAENADVSASIVSSSRRESVRAEVRYLMTRLQIGSTESKSSALESLLGLFQEDGKNLLIAVAQGIVPVLVHLLDCTSSSELKEKSVSAIAKISTEDSSKHVLLAEGLVLLNNLMRVLESGSVFAKEKSCIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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