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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003306`

染色体: Chr04 坐标: 49789894-49790736 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003306`
名称	SmilChr04G003306
描述	uncharacterized SmilChr04G003306
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49789894 - 49790736 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023555`
GeneID	`131023555`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023555`
原始查询	`SmilChr04G003306`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824041]; symbol=AT3G48800; hit=AT3G48800; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824041]; symbol=AT3G48800; hit=AT3G48800; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G48800` (AT3G48800) Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824041] identity=32.9; qcov=1.01; evalue=2.46e-26; confidence=low
Rice	`Os03g0850300` - identity=74.6; qcov=0.211; evalue=2.76e-23; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00536 (SAM_1); PF07647 (SAM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023555

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809083.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809083.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809083.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809083.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809083.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49790218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C42
`Chr4:49790244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B139,C18,C27
`Chr4:49790294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C40
`Chr4:49790350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B125,B90,B92,C87
`Chr4:49790443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C50,D6
`Chr4:49790605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:49790665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809083.1

280 aa

140

280

SAM_2

SAM_1

PF07647 SAM_2 217-275 aa PF00536 SAM_1 218-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809083.1`	Pfam	`PF07647`	SAM_2	Domain	217	275	1.4e-14	54.6	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057809083.1`	Pfam	`PF00536`	SAM_1	Domain	218	275	3.3e-12	47.3	SAM domain (Sterile alpha motif)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953100.1
ATGCAGCCCGACGGCGGCGAGGCGGCGGCCGTGCCGCAGGAGAACGCCAAGCGGATGCGGCGGCCGAGCGTCAGATTGCACCAGCCCTATTACGAAAACCCTGGCCACCGCAAGCTGCAGCAACAATGGAAGCCCAGGAAAGGCGCCACCACACCCAGAAAGCCTCGAACCGCCAAAACCGCGCATTCGAAATTCACCAAGAACGAGCGTGGCAAATGGGAAGGAGTGGGGAATCTTGATTTCGACGACGATGTGGCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023555
ATGCAGCCCGACGGCGGCGAGGCGGCGGCCGTGCCGCAGGAGAACGCCAAGCGGATGCGGCGGCCGAGCGTCAGATTGCACCAGCCCTATTACGAAAACCCTGGCCACCGCAAGCTGCAGCAACAATGGAAGCCCAGGAAAGGCGCCACCACACCCAGAAAGCCTCGAACCGCCAAAACCGCGCATTCGAAATTCACCAAGAACGAGCGTGGCAAATGGGAAGGAGTGGGGAATCTTGATTTCGACGACGATGTGGCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809083.1
MQPDGGEAAAVPQENAKRMRRPSVRLHQPYYENPGHRKLQQQWKPRKGATTPRKPRTAKTAHSKFTKNERGKWEGVGNLDFDDDVAIGSWGNFTAANRDRDFQRKRVRSSNSKSGVPPKSRRIGDQEIGNLGLSTDGETAEHEQQAIGVEEERDLGGNLISSNLVVEDSDPSSPHYSVDDGNHKSSGDHDNVGGKQRGLRDNEMGRALMAREGDGDNSGVKMWLNDLGLGKYVTLFEIHGVDDEVLPLLTLEDLKDMGIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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