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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003314`

染色体: Chr04 坐标: 49879211-49885029 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003314`
名称	SmilChr04G003314
描述	uncharacterized SmilChr04G003314
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49879211 - 49885029 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020210`
GeneID	`131020210`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020210`
原始查询	`SmilChr04G003314`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824044]; symbol=AT3G48830; hit=AT3G48830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824044]; symbol=AT3G48830; hit=AT3G48830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G48830` (AT3G48830) tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824044] identity=62; qcov=0.954; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0395900` - identity=58.5; qcov=0.874; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0006396 (RNA processing); GO:0016779 (nucleotidyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01743 (PolyA_pol); PF12627 (PolyA_pol_RNAbd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020210

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804889.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057804889.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804889.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804889.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804889.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49879384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:49880513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B78,B79
`Chr4:49882088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B55,B81,C21,C6
`Chr4:49882500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B134,B57,B88,D11
`Chr4:49882901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C11,C69
`Chr4:49883949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:49884058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:49884208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C73
`Chr4:49884280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:49884580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr4:49884668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804889.1

522 aa

261

522

PolyA_pol

PolyA_pol_RNAbd

PF01743 PolyA_pol 95-223 aa PF12627 PolyA_pol_RNAbd 250-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804889.1`	Pfam	`PF01743`	PolyA_pol	Domain	95	223	1.2e-21	78.0	Poly A polymerase head domain
`XP_057804889.1`	Pfam	`PF12627`	PolyA_pol_RNAbd	Domain	250	311	4.4e-12	46.3	Probable RNA and SrmB- binding site of polymerase A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948906.1
CGTACGTTATCTTCAACAACTGGAAGCGCGCTTACAGCTTTTTGGTTGAGATAATTTGATGCATCTCCTTAAACCCCAGAGATTTTAAGGTCTGTATTCCTTTCATGTCAAAAATTTGAGTTGATAAACCCTAGTTCCCCATGTGATGGCCATCTCAACCGGCCTGGGTATTTCTCGTCTTCCATCCCTCTCTCTCCGTTACCCTTTCCGCCACTGTGCTCTTCAGGTAAGGCTGGGCTGTGCTGCTGCTTCGGTTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020210
ATGGCCATCTCAACCGGCCTGGGTATTTCTCGTCTTCCATCCCTCTCTCTCCGTTACCCTTTCCGCCACTGTGCTCTTCAGGTAAGGCTGGGCTGTGCTGCTGCTTCGGTTGAAGCATTCGACGATACGGAGAATGACAAATCATTTGATAATTTGAGTGGTCGCGATGCATGTCGAAAGGATTGGAAGAAGTTGAAGTCTGAAGACCTTGGAATTAGGACTTCCAAAATTTCGAGGCCCACAAGAGTGGTTCTTAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804889.1
MAISTGLGISRLPSLSLRYPFRHCALQVRLGCAAASVEAFDDTENDKSFDNLSGRDACRKDWKKLKSEDLGIRTSKISRPTRVVLNGLKKRGFEVYLVGGCVRDLILRRVPKDFDVLTSAELKDVMRTFSRCEMIGRRFPICHVHIDDTIVEVSSFSTRATRYGRFLSLDPEKPVGCDEKDYIRWRNCLERDFTINGLMFDPYAKLIYDYTGGVNDIRKAKIRTIKPANLSLTEDCARILRAVRIAARLDFRLSRETALA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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