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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003329`

染色体: Chr04 坐标: 50010495-50013727 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003329`
名称	SmilChr04G003329
描述	E3 SUMO-protein ligase MMS21-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50010495 - 50013727 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020226`
GeneID	`131020226`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020226`
原始查询	`SmilChr04G003329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 SUMO-protein ligase MMS21-like
产物	E3 SUMO-protein ligase MMS21-like
Arabidopsis	`AT3G15150` (HPY2) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820746] identity=51.9; qcov=0.972; evalue=6.07e-91; confidence=high
Rice	`Os05g0563500` - identity=47.3; qcov=0.964; evalue=1.19e-83; confidence=high
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0005634 (nucleus); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0030915 (Smc5-Smc6 complex); GO:0061665 (SUMO ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF11789 (zf-Nse)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020226

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804906.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057804906.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.80000	`XP_057804906.1`
4	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057804907.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057804906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804906.1

275 aa

138

275

zf-Nse

PF11789 zf-Nse 144-205 aa

XP_057804907.1

250 aa

125

250

zf-Nse

PF11789 zf-Nse 144-206 aa

XP_057804908.1

250 aa

125

250

zf-Nse

PF11789 zf-Nse 144-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804906.1`	Pfam	`PF11789`	zf-Nse	Domain	144	205	2.5e-13	50.3	Zinc-finger of the MIZ type in Nse subunit
`XP_057804907.1`	Pfam	`PF11789`	zf-Nse	Domain	144	206	3.3e-14	53.2	Zinc-finger of the MIZ type in Nse subunit
`XP_057804908.1`	Pfam	`PF11789`	zf-Nse	Domain	144	206	3.3e-14	53.2	Zinc-finger of the MIZ type in Nse subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948923.1
ATTGTGAAAGGGCCCAATACTTAATATTTAGGGCTCATCTTTTAAATTAATGAAGGCCCAACCTCTTGTCTCCAAGCTCCTCCGATCCCTCCTTCTTCTTCCATTTCCGGCAAAACACTCTCCTTCTAATTCTTCTCCTCAATTCCTTCCGACGACTCCTCCTCGCCGACCGTAGCCTATCGCATATCGCCGTCTCCATCTGCGCGTTTCCATCAATCGCCGCGGAGTATGCCCTTCTCTCTATGATCTTAGTTATTTAT...

XM_057948925.1
TGAAAGGGCCCAATACTTAATATTTAGGGCTCATCTTTTAAATTAATGAAGGCCCAACCTCTTGTCTCCAAGCTCCTCCGATCCCTCCTTCTTCTTCCATTTCCGGCAAAACACTCTCCTTCTAATTCTTCTCCTCAATTCCTTCCGACGACTCCTCCTCGCCGACCGTAGCCTATCGCATATCGCCGTCTCCATCTGCGCGTTTCCATCAATCGCCGCGGAATAGATAGATTCTCGAGTTTCCATACCCTTTCGGCCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020226
ATGGCGTACACCTCCGCTCCGCGCAGCGGCGTACAGGGAAGAATTGCGTCGGCGGCTACAACGCTATACTCTGACAACCAGAGTCTCATTGCTGAGATTAGAAAGGCTACTATTATGATGAAAGAGATTGGAGTCGACTTCGAGAAGGACAACGAATCAGATATGGTGAAGCAGCTTGAAGATGGAGTTATTAACTTAGTGAAAGCTTCCGATGAGTGTACTCATCTTTCCAGTGCTATCCAATCTATAGGAAAAGAATA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804906.1
MAYTSAPRSGVQGRIASAATTLYSDNQSLIAEIRKATIMMKEIGVDFEKDNESDMVKQLEDGVINLVKASDECTHLSSAIQSIGKEYQPAAELTNFSKLFDKKIKRSMADTSSDSQSRLWLRQFREAIWKVHHDGQPMPGEEQDDIVMTSTECNLLNTTCPLTGKPITELAEPVRSMDCKHIYEKNAIMQHLRSKAATNRCPVTGIFWQLFLMKLSCYEIESLCDDLLSACPKILLAGRVVCDPFLVIEIDEMRSLNAQR...

XP_057804907.1
MAYTSAPRSGVQGRIASAATTLYSDNQSLIAEIRKATIMMKEIGVDFEKDNESDMVKQLEDGVINLVKASDECTHLSSAIQSIGKEYQPAAELTNFSKLFDKKIKRSMADTSSDSQSRLWLRQFREAIWKVHHDGQPMPGEEQDDIVMTSTECNLLNTTCPLTGKPITELAEPVRSMDCKHIYEKNAIMQHLRSKAATNRCPVTACPKILLAGRVVCDPFLVIEIDEMRSLNAQRVRADAIEDFTQLEDH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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