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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003330`

染色体: Chr04 坐标: 50016167-50018450 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003330`
名称	SmilChr04G003330
描述	uncharacterized SmilChr04G003330
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50016167 - 50018450 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020227`
GeneID	`131020227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020227`
原始查询	`SmilChr04G003330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=24.6; qcov=0.603; evalue=2.83e-06; confidence=weak
Rice	`Os02g0328500` - identity=30.6; qcov=0.505; evalue=2.46e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804909.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804909.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804909.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804909.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804909.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50016435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A11,A14,A18,A24,B118,B57,B77,C28,C31,C45,C54
`Chr4:50016894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:50016916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C54
`Chr4:50016917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D9
`Chr4:50016927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:50016929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D11
`Chr4:50016931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:50016944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:50016953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:50016956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C68,C77
`Chr4:50017019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:50017024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B138,B31,B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804909.1

317 aa

158

317

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 29-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804909.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	29	123	1e-05	27.1	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948926.1
ACGAATTTCCTGAATTACCCAAAGACACAAGAACCTCATCCACGTAATCACGATCTCTGCTTCAAGAGAACCCATTTTTTGTACACGATCTCTGCTTCAAGAAGCCATTTTTGGCACTATAAAATATGGGAATTTGGAGGGAAAAGATTCGTGACTTTCAAAGAGAGACCACTGATCTGCCATCTGCTTTGTCCATTCTCGATCACCGGCAGCTACCAATCGGAGTTTGTGATTCACCGTGGTTGCTTTCCAGATGGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020227
ATGGTTTCGAATATCCAAGGAGTTGATACGGAGAGCAGCGACGCGTCTCGTAGTCGGGCTAACAGAACGGGAAATACTCGCCGTTCTTGGTCTACAAGGGAAGAGCATGTGTTGTTGTCATCGTTGAAAGAATTAGTTGCAAATGGCTGGAAATCGGACAATGGATTTCGAGCAGGGTTCCTCGGTAAACTTGAGGACGCCTTGAAGAAGGAGTTTCCGGGCACCGATTTAAAAGCTACACCACATATCAATTCAAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804909.1
MVSNIQGVDTESSDASRSRANRTGNTRRSWSTREEHVLLSSLKELVANGWKSDNGFRAGFLGKLEDALKKEFPGTDLKATPHINSKIGTWKKSYYSLTSMLGNSGIGFNSDYMIDCDNDLWEQIVKKDPAARSMRHKSWPLFEDWKEIFGKDRANGDKAEDLMDAINDMTSRDNLERDAIPEEQGQNVQLEDENDIDAVDDSACQSQKEGDRARASRKKRRQDEAIDRVHDMLVELGRNTDKRLEHIGNRIGYEFDLSKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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