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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003339`

染色体: Chr04 坐标: 50063794-50066373 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003339`
名称	SmilChr04G003339
描述	type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 9-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50063794 - 50066373 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020237`
GeneID	`131020237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020237`
原始查询	`SmilChr04G003339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 9-like
产物	type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 9-like
Arabidopsis	`AT2G01900` (AT2G01900) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814721] identity=49; qcov=0.963; evalue=8.01e-125; confidence=high
Rice	`Os09g0394600` - identity=54; qcov=0.819; evalue=3.01e-118; confidence=high
GO	GO:0004439 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0004445 (inositol-polyphosphate 5-phosphatase activity); GO:0034485 (phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0046856 (phosphatidylinositol dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF22669 (Exo_endo_phos2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804922.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804922.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804922.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804922.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50065138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:50065169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C29
`Chr4:50066045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C53,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804922.1

420 aa

210

420

Exo_endo_phos2

PF22669 Exo_endo_phos2 60-384 aa

XP_057804923.1

409 aa

204

409

Exo_endo_phos2

PF22669 Exo_endo_phos2 60-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804922.1`	Pfam	`PF22669`	Exo_endo_phos2	Domain	60	384	9.7e-74	249.2	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2
`XP_057804923.1`	Pfam	`PF22669`	Exo_endo_phos2	Domain	60	373	8.8e-61	206.7	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948939.1
TTCTGCACTTTCGTGGTTTCACTTCCACCTATAAACAATACTGGCTCTACAACACTGACATTCCATCACGGAAGTAGGAATTAATGTACTTCTCTATATTTAAATAAAGCAGAGATTTCCCGTTGACATCATGGTTGCAGAGCTTATCATGGAGGCAAGTAATATCCTTAGGAAAAGAGTGGTCGATGATTCTTTCATTCCACACTTTGGTAATATGCCAGAAACTTCAGCACAAAACTCAAATCAAGCTTACTTCAGCT...

XM_057948940.1
ATATTTAAATAAAGCAGAGATTTCCCGTTGACATCATGGTTGCAGAGCTTATCATGGAGGCAAGTAATATCCTTAGGAAAAGAGTGGTCGATGATTCTTTCATTCCACACTTTGGTAATATGCCAGAAACTTCAGCACAAAACTCAAATCAAGCTTACTTCAGCTCCCAAGAGTATTGTATTCCTCAAGGATCTTTCGAAGTGTTTGTAGGCTCTTGGAATGTAGGAGGCATCCGACCTCCAGACAACTTGAACCTCGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020237
ATGGTTGCAGAGCTTATCATGGAGGCAAGTAATATCCTTAGGAAAAGAGTGGTCGATGATTCTTTCATTCCACACTTTGGTAATATGCCAGAAACTTCAGCACAAAACTCAAATCAAGCTTACTTCAGCTCCCAAGAGTATTGTATTCCTCAAGGATCTTTCGAAGTGTTTGTAGGCTCTTGGAATGTAGGAGGCATCCGACCTCCAGACAACTTGAACCTCGACAAGTGGCTCAGTACTCAAGACACCATGGCAGATAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804922.1
MVAELIMEASNILRKRVVDDSFIPHFGNMPETSAQNSNQAYFSSQEYCIPQGSFEVFVGSWNVGGIRPPDNLNLDKWLSTQDTMADIYVLGFQEIVPLTAGNILAAENSDISKHWNSLIKAALNKRTLTEDTLQKTEVGESQRIYPLRTQSSIKSNATDYKCIINKQMVGIYITMWARTDLHQYISNLGVSCVGCGILGRLGNKGSVSIRFCLHETSFCFVCSHLASGGKEGDERHRNADAAHILARTLFPPEPLQHLPR...

XP_057804923.1
MVAELIMEASNILRKRVVDDSFIPHFGNMPETSAQNSNQAYFSSQEYCIPQGSFEVFVGSWNVGGIRPPDNLNLDKWLSTQDTMADIYVLGFQEIVPLTAGNILAAENSDISKHWNSLIKAALNKRTLTEDTLQKTEVGESQRIYPLRTQSSIKSNATDYKCIINKQMVGIYITMWARTDLHQYISNLGVSCVGCGILGRLGNKGSVSIRFCLHETSFCFVCSHLASGGKEGDERHRNADAAHILARTLFPPEPLQHLPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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