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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003344`

染色体: Chr04 坐标: 50091831-50102391 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003344`
名称	SmilChr04G003344
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50091831 - 50102391 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023561`
GeneID	`131023561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023561`
原始查询	`SmilChr04G003344`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
产物	alpha-1%2C3-arabinosyltransferase XAT3-like
Arabidopsis	`AT3G18180` (AT3G18180) Glycosyltransferase family 61 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821345] identity=41.2; qcov=0.775; evalue=1.48e-73; confidence=medium
Rice	`Os03g0567600` (OsXAT3) - identity=43.2; qcov=0.814; evalue=1.55e-76; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04577 (Glyco_transf_61)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057809089.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057809089.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809089.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057809089.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50092790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:50092913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,A9,B134,B77
`Chr4:50093048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr4:50093260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:50093347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B4,B89,C19
`Chr4:50093426`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr4:50093426`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr4:50102153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr4:50102161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B12,C48
`Chr4:50102198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B89
`Chr4:50102218`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr4:50102218`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B106

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809089.1

404 aa

202

404

Glyco_transf_61

PF04577 Glyco_transf_61 94-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809089.1`	Pfam	`PF04577`	Glyco_transf_61	Family	94	277	5.5e-17	63.0	Glycosyltransferase 61

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953106.1
ATGACAGATTGTGACATCTTCAACTACTCCAACTCTAGATCCGATGTGTATGAATTAAACGGCGACGTACGCATCCACGGCGCCTCTTCCACCATTTTCATACCACCTTCAAACCACCTGACCTCCATCAAAATAAAACCCTACCCACGAAAATACGACGCCGCCGCCATGACCACCGTCTCCGCTTTCCAAATCAAGGCAGACAAACTCCCTCATTGCACCCAAACCCTCGCCGCCCCGGCCATCCTCTTCTCGACCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023561
ATGACAGATTGTGACATCTTCAACTACTCCAACTCTAGATCCGATGTGTATGAATTAAACGGCGACGTACGCATCCACGGCGCCTCTTCCACCATTTTCATACCACCTTCAAACCACCTGACCTCCATCAAAATAAAACCCTACCCACGAAAATACGACGCCGCCGCCATGACCACCGTCTCCGCTTTCCAAATCAAGGCAGACAAACTCCCTCATTGCACCCAAACCCTCGCCGCCCCGGCCATCCTCTTCTCGACCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809089.1
MTDCDIFNYSNSRSDVYELNGDVRIHGASSTIFIPPSNHLTSIKIKPYPRKYDAAAMTTVSAFQIKADKLPHCTQTLAAPAILFSTGAHAGNHFHSIADVLVPLFATSHRFNRHVIFLVTNHDSRLTSKHTKTLQRLSKYDVVDIDAQNQTLCFPGMIVGLRADTTDLSIDPSPFSSFSARNFTKLLRSAYSLERESVRGHYRPRMLIISRARSRRLSNEVEVVELARSLGFECVAQDLRGEIESVAKIVNSVDVMVGVH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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