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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003345`

染色体: Chr04 坐标: 50102593-50104370 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003345`
名称	SmilChr04G003345
描述	uncharacterized SmilChr04G003345
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50102593 - 50104370 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023562`
GeneID	`131023562`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023562`
原始查询	`SmilChr04G003345`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=22.2; qcov=1.1; evalue=6.61e-37; confidence=weak
Rice	`Os01g0595300` - identity=23.5; qcov=1.12; evalue=4.15e-41; confidence=weak
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023562

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809090.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809090.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809090.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809090.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50102599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A10,B115,C71
`Chr4:50102599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B115,C71
`Chr4:50102629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:50102641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C18,C21,D1
`Chr4:50102643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,C18,C21,D1,D10
`Chr4:50102669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:50102670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B34,C69
`Chr4:50102682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:50102709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B67,C87
`Chr4:50102715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A19,A4,B120,B130,B18,B8,C39
`Chr4:50102724`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr4:50102724`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809090.1

506 aa

253

506

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 141-215 aa PF00872 Transposase_mut 141-291 aa PF04434 SWIM 366-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809090.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	141	215	4e-12	47.1	MULE transposase domain
`XP_057809090.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	141	291	5.3e-09	36.2	Transposase, Mutator family
`XP_057809090.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	366	396	1.1e-07	31.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953107.1
ATGAAGCAGGGCAAGGAATTTTCTGTCAGCAAATCAGACAGCAGACGAGTCTACTTCAAATGCAAGCATTCAGATACGTGCCCCTTCAAGCTCCATGCATCGTCACAAGATGGAGCCATTTGGGGAGTGTATAAGTTCACCAATGAGCACTCATGCGACGGTGAGCTAGGGCGCGTAGCGCGAATAAAGGCCCCCGCAAAAGTCGTCGCAACATATCTAGCACAGAAAATACACGACGATTGCGAGATCTTGAAGCCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023562
ATGAAGCAGGGCAAGGAATTTTCTGTCAGCAAATCAGACAGCAGACGAGTCTACTTCAAATGCAAGCATTCAGATACGTGCCCCTTCAAGCTCCATGCATCGTCACAAGATGGAGCCATTTGGGGAGTGTATAAGTTCACCAATGAGCACTCATGCGACGGTGAGCTAGGGCGCGTAGCGCGAATAAAGGCCCCCGCAAAAGTCGTCGCAACATATCTAGCACAGAAAATACACGACGATTGCGAGATCTTGAAGCCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809090.1
MKQGKEFSVSKSDSRRVYFKCKHSDTCPFKLHASSQDGAIWGVYKFTNEHSCDGELGRVARIKAPAKVVATYLAQKIHDDCEILKPKAIQLELRREFGIQIKYDVALRARNRATEMVYGRHDQSFEMLPKYLYMLRQSNPVTKDGNESLFPLAYGVGPKENDESWTYFMSRIRRVYGQADPLLIVSDQHISIANAIRNELPNETHGLCYYHLQNNLKHYGKAVVEVYRQAAFAYEKSDFNRAMNALKVMKRVAYDKLMGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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