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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003346`

染色体: Chr04 坐标: 50104510-50105156 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003346`
名称	SmilChr04G003346
描述	uncharacterized SmilChr04G003346
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50104510 - 50105156 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023563`
GeneID	`131023563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023563`
原始查询	`SmilChr04G003346`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809091.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057809091.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057809091.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057809091.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809091.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50104536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B120,B19,B23,B38,B39,C34,C4
`Chr4:50104547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B2
`Chr4:50104555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,D9
`Chr4:50104558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,C87,D10
`Chr4:50104559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,D11
`Chr4:50104586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:50104593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B26,C6,D11
`Chr4:50104597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A20,B103,B51
`Chr4:50104604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B4,B64,B78,C42
`Chr4:50104670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr4:50104673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B26,C6,D11
`Chr4:50104684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809091.1

188 aa

188

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 37-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809091.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	37	175	3.9e-07	30.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953108.1
ATGGCTGATGGTTGGGAGCCTGAGATAGACTGGCTCTGCCAAGTACGTGGAAAATCACTTAAGGGCCATGAACTTCCTCCTGGTCATATAGGATGGATGGATGCCACACAGGTTCTCATGCCAGTCATAATTGGCCACCATTTTATCCTATGTCGGATTCGGTTAGGAGAAGCCGTTTGCGAGGTCTATGACCCAGTATTCCACAAGCTAACACCTCGACAACAGGATGCTCGAGTTGGTGATTTACTACCTTTACTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023563
ATGGCTGATGGTTGGGAGCCTGAGATAGACTGGCTCTGCCAAGTACGTGGAAAATCACTTAAGGGCCATGAACTTCCTCCTGGTCATATAGGATGGATGGATGCCACACAGGTTCTCATGCCAGTCATAATTGGCCACCATTTTATCCTATGTCGGATTCGGTTAGGAGAAGCCGTTTGCGAGGTCTATGACCCAGTATTCCACAAGCTAACACCTCGACAACAGGATGCTCGAGTTGGTGATTTACTACCTTTACTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809091.1
MADGWEPEIDWLCQVRGKSLKGHELPPGHIGWMDATQVLMPVIIGHHFILCRIRLGEAVCEVYDPVFHKLTPRQQDARVGDLLPLLRLLPVVLQVSRWLDDTSIDSTVAKNKWPLMTAEFAPAEVQFHQQDSVNCGPFVCMYAERLISGSPSIEWGNSNMAAYRSKISRSIFSLCETWKVRCDRLGFR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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