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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003360`

染色体: Chr04 坐标: 50196652-50204421 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003360`
名称	SmilChr04G003360
描述	uncharacterized SmilChr04G003360
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50196652 - 50204421 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020257`
GeneID	`131020257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020257`
原始查询	`SmilChr04G003360`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine protein kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830712]; symbol=PK3; hit=AT5G08160; species=arabidopsis; confidence=high
产物	serine/threonine protein kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830712]; symbol=PK3; hit=AT5G08160; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G08160` (PK3) serine/threonine protein kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830712] identity=81.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0372800` - identity=74.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804947.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804947.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804947.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804947.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50196946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,D11
`Chr4:50196956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,D11
`Chr4:50197039`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	136	A10,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A9,B100,B102,B106,B108,B11,B110,B111,B113,B114,B118,B119,B125,B127,B128,B129,B130,B131,B135,B137,B138,B14,B15,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B24,B26,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B45,B50,B51,B55,B56,B59,B6,B60,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B76,B77,B78,B81,B82,B83,B84,B85,B88,B92,B93,B95,B96,B97,B98,C12,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C25,C29,C34,C35,C36,C37,C4,C42,C43,C45,C46,C48,C5,C51,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C63,C64,C69,C7,C70,C74,C75,C76,C78,C80,C82,C84,C85,C86,D1,D10,D11,D4,D7
`Chr4:50197073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B6
`Chr4:50197093`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	61	A14,A16,A18,A21,A4,A5,A6,B100,B106,B11,B110,B113,B114,B119,B127,B129,B130,B135,B137,B138,B20,B33,B36,B37,B38,B45,B50,B55,B56,B6,B66,B68,B69,B70,B84,B88,B95,B96,B97,C13,C2,C23,C34,C35,C4,C43,C46,C48,C5,C58,C59,C64,C7,C70,C82,C85,C86,C9,D1,D11,D4
`Chr4:50203981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804947.1

344 aa

172

344

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 58-334 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 67-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804947.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	58	334	4.1e-31	109.1	Protein kinase domain
`XP_057804947.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	67	331	2.7e-14	53.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948964.1
AAATTGGAATAATAGCTCCTGGTACAATCAAGACAAATAAATACTTTATATGTGAAATTATTACAACATTTTTCATATTTGACTTGAATATTAATTTATTTATTAACGAAGGTGCGTGCGTGAGTCTCAATCTCTTTAACTAAGACCACTCCCGGCGCAGATCCATCTGATTCTGGCTTTGAATTGGGGATTCGAGTTCGAGAGAGTGAGTGGCAAACCTCTCCATTTCACATCAGATTCTCTCAGATTGGAAGGCAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020257
ATGGGGTGCTCGTTCTCCGGTTTGAATGCTCTGTACGACGCCGTTAATGGCGCCGGTGATGTTTGGATCAACGAGAACCGTTTCAGGATTGTACGCCAGCTCGGAGAGGGCGGCTTTGCCTTTGTCTACCTCGTCAAGGAGCTCATCTCCGATCCTTCCAATCCCGCCGCTGGCATTTCCGCCAAAATCAAGGATTCTTCGCATATCTCCGGTGATGGAACATATGCAATGAAGAAAGTTCTGATTCAAAACGGCGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804947.1
MGCSFSGLNALYDAVNGAGDVWINENRFRIVRQLGEGGFAFVYLVKELISDPSNPAAGISAKIKDSSHISGDGTYAMKKVLIQNGEQLQMVRDEIRVSSQFNHPNLLPLLDHAIIAVKASQDQSWKHEAYLLFPVHLDGTLLDNTTAMKAKKEFFSTSDVLQILHQLCAGLKHMHSFDPPYAHNDVKPGNVLVTYRKGQPPVAILMDFGSARPARRQIRSRSEALQLQEWASEHCSAPFRAPELWDCPSHADIDERTDIW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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