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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003367`

染色体: Chr04 坐标: 50251402-50253987 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003367`
名称	SmilChr04G003367
描述	transcription factor MYBS1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50251402 - 50253987 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020265`
GeneID	`131020265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020265`
原始查询	`SmilChr04G003367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYBS1
产物	transcription factor MYBS1
Arabidopsis	`AT1G49010` (AT1G49010) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841324] identity=58; qcov=0.923; evalue=5.85e-93; confidence=high
Rice	`Os01g0524500` (OsMYBS1) - identity=48.7; qcov=1.01; evalue=4.83e-73; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804957.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804957.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804957.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804957.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50252776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr4:50252806`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B118
`Chr4:50252806`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B118
`Chr4:50252944`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr4:50252944`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr4:50253088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:50253107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50253446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C6
`Chr4:50253489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:50253522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C79,C8
`Chr4:50253547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C50
`Chr4:50253602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804957.1

299 aa

150

299

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 6-56 aa PF00249 Myb_DNA-binding 131-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804957.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	6	56	1.8e-20	73.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057804957.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	131	176	1.8e-20	73.4	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948974.1
TTTTTTTTTTTTGACTTGGGGGAGTTGGTGAGGGGGAGCAGTGAGGTTTGAACCTGGGACCTTACTGTTCACACAGGAGGTCGCACCGCTTGGTGTCCCCTTAGGGGACTAATATTTAGTTATCTTAATTCCAAATAGTGTTAACGAGAGAAATTTCTTTGGGTATATAGTATTTTTCGGTAGTAATAACTTCAAATTCCAACCTGGTATTACAACATATTACAATCAAAATCTCATTTAAATATGCAATTGACCTTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020265
ATGTCGGGAACAAGTAGAGGTTGGTGGAGCAGGGAAGAAGAAAAGGCATTTGAGAATGGCATTGCGATGCACTGGAACGAGGAATGCAGGGAGCAGAGCTGGACCAAGATTGCTTCAATGGTTCCCACCAAAAGCATTCTTGAATTGAAGCATCACTACCTGCTTCTGCTTGAAGATGTAGCCGCCATTGAAGCTGGGAATGTGCCATTGCCTAGTTACAATATCACCACCTCTTCTTTGCTCTCCACCACTACTTATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804957.1
MSGTSRGWWSREEEKAFENGIAMHWNEECREQSWTKIASMVPTKSILELKHHYLLLLEDVAAIEAGNVPLPSYNITTSSLLSTTTYNHPKDKPFSNSTFSSHDSVTAQPPAAAKAGGGSSRSDQERRKGIPWTEEEHRLFLLGLDKFGKGDWRSISRNFVISRTPTQVASHAQKYFIRLNSMNRDRRRSSIHDITSVNGEIPSSAHMPPLITGQHVHPPPPAAPPAMKHHHRPNMHGLGMYGGAPVGQPVAVPPGRHIAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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