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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003372`

染色体: Chr04 坐标: 50284785-50286515 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003372`
名称	SmilChr04G003372
描述	protein ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50284785 - 50286515 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020270`
GeneID	`131020270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020270`
原始查询	`SmilChr04G003372`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 1-like
产物	protein ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 1-like
Arabidopsis	`AT3G18490` (ASPG1) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821379] identity=51.1; qcov=1.06; evalue=4.04e-157; confidence=high
Rice	`Os01g0140100` - identity=58.3; qcov=0.763; evalue=7.28e-142; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057804967.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057804967.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804967.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804967.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50284974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B9
`Chr4:50285023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:50285058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B113,B135,B63,B90
`Chr4:50285059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B113,B135,B63,B90
`Chr4:50285200`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	160	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B112,B114,B118,B12,B122,B123,B125,B127,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B139,B140,B19,B2,B23,B24,B25,B27,B28,B30,B33,B35,B36,B4,B41,B42,B43,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B63,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B82,B84,B86,B89,B9,B90,B93,B95,B98,C1,C11,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C45,C46,C49,C50,C51,C53,C54,C56,C57,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C77,C8,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D4,D5,D8,D9
`Chr4:50285331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B119,B45,B97
`Chr4:50285463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C19,C86
`Chr4:50285468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:50285511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B114,B20
`Chr4:50286006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50286038`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr4:50286038`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804967.1

465 aa

232

465

Asp

TAXi_N

TAXi_C

PF00026 Asp 128-462 aa PF14543 TAXi_N 129-287 aa PF14541 TAXi_C 312-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804967.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	128	462	2e-23	84.0	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057804967.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	129	287	1.8e-46	159.3	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057804967.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	312	461	2.2e-32	112.8	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948984.1
CATTGAATAAAAGCTTAAATGAATTATTTCAAGTTTGAATAAATTGCGCCTATTAATCCATCACCCATCTCATTCATTAATTCATTAATCTTCAAGCATGTTTCGCAACAAATTTACTTCTCTCTCTATTACATGTTTAATTTTGTGTCTCATCTCAAACCCTTCACCCTCATCATCCTCAAATGATCACAGCTTTCAGATTCTCGACGTCTCAAAATCATTACAACAAACTCGCAACGCTTCCTCTCCATCTTCAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020270
ATGTTTCGCAACAAATTTACTTCTCTCTCTATTACATGTTTAATTTTGTGTCTCATCTCAAACCCTTCACCCTCATCATCCTCAAATGATCACAGCTTTCAGATTCTCGACGTCTCAAAATCATTACAACAAACTCGCAACGCTTCCTCTCCATCTTCAACCCACCACTTCAACTCCGCTCTCTCTCTAACTCTCTCCTCTCTCCCCTTCAACTCCAACAGCAACTACACCTCCCTCACCCTCTCCCGCTTCACCCGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804967.1
MFRNKFTSLSITCLILCLISNPSPSSSSNDHSFQILDVSKSLQQTRNASSPSSTHHFNSALSLTLSSLPFNSNSNYTSLTLSRFTRDQARVRHLLHHHSLSLSKSKSKSRNPNFQSPVTSGFGQGTGEYLARIGVGRPVKQFYMAIDTGSDVSWLQCRPCFSCFQQSDPIFNPSASSTYKSLSCTSKQCAALDTSACFRDNCIYQVSYGDGSYTVGNFATETISFGSSGSVSGVAIGCGHDNEGLFTGSEGLLGLGGSSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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