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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003374`

染色体: Chr04 坐标: 50299243-50314451 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003374`
名称	SmilChr04G003374
描述	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50299243 - 50314451 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020272`
GeneID	`131020272`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020272`
原始查询	`SmilChr04G003374`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
产物	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
Arabidopsis	`AT1G09730` (AT1G09730) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837501] identity=44.9; qcov=0.593; evalue=2.4e-132; confidence=medium
Rice	`Os05g0207900` - identity=50.8; qcov=0.427; evalue=2.89e-120; confidence=low
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF25352 (PH_ULP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020272

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804969.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804969.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804969.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804969.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50299682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50303400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C75
`Chr4:50303400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr4:50303641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr4:50303643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50306538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50307632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B89
`Chr4:50311649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:50312052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50312084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:50312166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C2
`Chr4:50313432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B4,C19,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804969.1

932 aa

466

932

PH_ULP

Peptidase_C48

PF25352 PH_ULP 214-336 aa PF02902 Peptidase_C48 395-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804969.1`	Pfam	`PF25352`	PH_ULP	Domain	214	336	2.7e-31	108.8	Ubiquitin-like protease PH domain
`XP_057804969.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	395	586	4.2e-32	112.5	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948986.1
GTTGGTGCGGTAAAAGTAATTTGCTATTTACAGCACGAAACATGAGAGACACGAAGAAATTAATTTCCAACGGGAAACAAAGAAAACGTCGCTACTTCTCGCGAAACTTAATTTGCAAAACCAGCGATCGCCGTCGGCCGAACCCTACCGGCTGCGGAAACAGCCGCCGCCTGCCTCTCGCCGGTTCTTCAAGACATGAGATCTTGACAAAATCAAAAGGAATGAAGAGTCCAAGCAAATCTTTCGACGTGTTTGACTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020272
ATGAGAGACACGAAGAAATTAATTTCCAACGGGAAACAAAGAAAACGTCGCTACTTCTCGCGAAACTTAATTTGCAAAACCAGCGATCGCCGTCGGCCGAACCCTACCGGCTGCGGAAACAGCCGCCGCCTGCCTCTCGCCGGTTCTTCAAGACATGAGATCTTGACAAAATCAAAAGGAATGAAGAGTCCAAGCAAATCTTTCGACGTGTTTGACTTCAAAGAAGAAGACGAGCTGGCTGAAATGACTGTCAAAAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804969.1
MRDTKKLISNGKQRKRRYFSRNLICKTSDRRRPNPTGCGNSRRLPLAGSSRHEILTKSKGMKSPSKSFDVFDFKEEDELAEMTVKKITPEFGCPQTLNAENYDEKKPELSPVLPNDFVSLGRAAEIKEVESEIIFSNVKYGSSPGDTLRSEDYSNNSFAVASCNVKSVHLASDAIDSMNERSPSDISNNNASSGGQSSDNCFGGGDLDGEREGIDFCADYLDYQGTQYMDYVINFSRSYVEARSRTIHEDEENFHIHMEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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