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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003376`

染色体: Chr04 坐标: 50324231-50325449 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003376`
名称	SmilChr04G003376
描述	mavicyanin-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50324231 - 50325449 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020274`
GeneID	`131020274`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020274`
原始查询	`SmilChr04G003376`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mavicyanin-like
产物	mavicyanin-like
Arabidopsis	`AT5G26330` (AT5G26330) Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832702] identity=50.9; qcov=0.605; evalue=3.59e-39; confidence=medium
Rice	`Os03g0807500` (OsSCL1) - identity=46.3; qcov=0.665; evalue=1.02e-31; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020274

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804971.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804971.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804971.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804971.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50324412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50324945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:50324953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:50325002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,C24,C27,C78,C85
`Chr4:50325049`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A9,C19,C35,C45
`Chr4:50325049`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A9,C19,C35,C45
`Chr4:50325059`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A9,C19,C35,C45
`Chr4:50325059`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A9,C19,C35,C45
`Chr4:50325062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,C19,C35,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804971.1

185 aa

185

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 36-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804971.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	36	118	1.1e-26	93.4	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948988.1
TATTATTAAAAAAGATGGGTGGAAAAAGGATTTATTTGTTGGTGTTGATGGTGATGATTTGTGGGAATTGCAGTGCTGGAGAAGTTCACAAGGTTGGTGAATCGTCTGGTTGGACCAACATAAATCTTGCTCCTTCATATTACAAATCTTGGACTGCTTCTAAACGCTTCCAAGTTGGTGACACCATTTTGTTCGAGTACAACAAGGAATTCCACAATGTGGTGAGGGTGACGCACAAGAACTTCAACGCGTGCAACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020274
ATGGGTGGAAAAAGGATTTATTTGTTGGTGTTGATGGTGATGATTTGTGGGAATTGCAGTGCTGGAGAAGTTCACAAGGTTGGTGAATCGTCTGGTTGGACCAACATAAATCTTGCTCCTTCATATTACAAATCTTGGACTGCTTCTAAACGCTTCCAAGTTGGTGACACCATTTTGTTCGAGTACAACAAGGAATTCCACAATGTGGTGAGGGTGACGCACAAGAACTTCAACGCGTGCAACACAAGCGCTCCCTACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804971.1
MGGKRIYLLVLMVMICGNCSAGEVHKVGESSGWTNINLAPSYYKSWTASKRFQVGDTILFEYNKEFHNVVRVTHKNFNACNTSAPYAAWGSGNDSFTIRRPGHYYFICGVPNHCWAGQKVDIRVAQHSPGPRPTPSSGPTSKSPLSVAQGPSSPPAHPPKKSASSSLHSHLKLWLGVVVAIGLAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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