Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003381`

染色体: Chr04 坐标: 50361686-50364722 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003381`
名称	SmilChr04G003381
描述	uncharacterized SmilChr04G003381
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50361686 - 50364722 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020279`
GeneID	`131020279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020279`
原始查询	`SmilChr04G003381`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0710600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0710600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G73885` (AT1G73885) AT-rich interactive domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843726] identity=68.1; qcov=0.528; evalue=1.91e-42; confidence=medium
Rice	`Os03g0710600` - identity=71; qcov=0.522; evalue=2.31e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804976.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057804976.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057804976.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804976.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804976.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100657.1
ATGGCTCTCGCCAGTAGTAGCAGCCGAATCCTGTGCAGCAGGAAGCCATGGAGCGAGAGTTCATCTCCTTCATGGTCTCACCGCCCCAGAACATCACCTTTCACTGTCTCCGCGACTCCCAAGAAGAACTCCCCTAGATCCGGAAGATTCGACAGTAAGAACCGCCGCAGCAGCCCCGTCATCACCAAGGATCAAGAGCAACTAGAAGAATTCATCCAAGACACGCCTGATATTAACGCCGTCGATGACGGATTCGTCAT...

XR_009100658.1
ATGGCTCTCGCCAGTAGTAGCAGCCGAATCCTGTGCAGCAGGAAGCCATGGAGCGAGAGTTCATCTCCTTCATGGTCTCACCGCCCCAGAACATCACCTTTCACTGTCTCCGCGACTCCCAAGAAGAACTCCCCTAGATCCGGAAGATTCGACAGTAAGAACCGCCGCAGCAGCCCCGTCATCACCAAGGATCAAGAGCAACTAGAAGAATTCATCCAAGACACGCCTGATATTAACGCCGTCGATGACGGATTCGTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020279
ATGGCTCTCGCCAGTAGTAGCAGCCGAATCCTGTGCAGCAGGAAGCCATGGAGCGAGAGTTCATCTCCTTCATGGTCTCACCGCCCCAGAACATCACCTTTCACTGTCTCCGCGACTCCCAAGAAGAACTCCCCTAGATCCGGAAGATTCGACAGTAAGAACCGCCGCAGCAGCCCCGTCATCACCAAGGATCAAGAGCAACTAGAAGAATTCATCCAAGACACGCCTGATATTAACGCCGTCGATGACGGATTCGTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804976.1
MALASSSSRILCSRKPWSESSSPSWSHRPRTSPFTVSATPKKNSPRSGRFDSKNRRSSPVITKDQEQLEEFIQDTPDINAVDDGFVMPELPGDKPSFWEGSQWDGLGFFVQYMWAFGIVFALVACGVAVATYNEGATDFKDTPVYKESVQSRDLLDEPDAANSDVFESNPTEQAPSLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器