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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003387`

染色体: Chr04 坐标: 50428416-50429756 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003387`
名称	SmilChr04G003387
描述	ribulose bisphosphate carboxylase small subunit, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50428416 - 50429756 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020307`
GeneID	`131020307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020307`
原始查询	`SmilChr04G003387`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribulose bisphosphate carboxylase small subunit, chloroplastic-like
产物	ribulose bisphosphate carboxylase small subunit%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G38410` (RBCS3B) Ribulose bisphosphate carboxylase (small chain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833828] identity=71.9; qcov=1.01; evalue=1.04e-91; confidence=high
Rice	`Os12g0291400` (RbcS5) - identity=68; qcov=0.96; evalue=9.73e-83; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00101 (RuBisCO_small); PF12338 (RbcS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805021.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057805021.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057805021.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805021.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50428977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C79
`Chr4:50428983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C79
`Chr4:50429002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B53
`Chr4:50429010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C54
`Chr4:50429322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C32,C68
`Chr4:50429337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B92,C8,C87
`Chr4:50429364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805021.1

176 aa

176

RbcS

RuBisCO_small

PF12338 RbcS 2-38 aa PF00101 RuBisCO_small 65-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805021.1`	Pfam	`PF12338`	RbcS	Family	2	38	9.5e-15	55.2	Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase small subunit
`XP_057805021.1`	Pfam	`PF00101`	RuBisCO_small	Domain	65	173	1.2e-34	118.9	Ribulose bisphosphate carboxylase, small chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949038.1
ATTATCCTATGAAACAACTGAAATTTCTGAAATCCCATCACATCATTAACGTTCAGAATTTCAAATGTGGACATAAACGTAATTTCCATCAATTCCAAAAACAAAAAAATATCTATGTAATTCAAATTCTAATCTAAAAGAAAGTAAAATAGTGATGTTGATACGAAGGGCTGTGCTGCATTTGCAGTGCTCAACCTCAAAACTCAAAGTCGCGCCCATCCACAGCAGATAAGATTAGCGCCACGTGGCGCTTTGGTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020307
ATGGCTTCCTCAATGCTCTCCACCGCTGCCACCGTCACCCCTGCTCAAGCCAGCATGGTGGCTCCTTTCACCGGCCTCAAGTCCGTCTCCGCCTTCCCCGGCAGCCGCAAGAGCGCCGACATCACCAGCATCGCCAGCAACGGCGGCAGAGTCTCGTGCATGCAGGTGTGGCCGACGGAGGGACTGAAGAAGTTCGAGACGTTGTCGTACTTGCCCCCTCTATCAAGGGAGCAACTGTTGAAGGAAGTTGAATACCTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805021.1
MASSMLSTAATVTPAQASMVAPFTGLKSVSAFPGSRKSADITSIASNGGRVSCMQVWPTEGLKKFETLSYLPPLSREQLLKEVEYLIRKNLIPCLEFELKDGFISRFNNRSPGYYDGRYWTMWKLPMFGCTDPVQVLKELDECSTLHPNAFIRIIGFDNVRQVQIISFIAHRPPGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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