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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003397`

染色体: Chr04 坐标: 50510155-50510932 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003397`
名称	SmilChr04G003397
描述	uncharacterized SmilChr04G003397
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50510155 - 50510932 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020315`
GeneID	`131020315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020315`
原始查询	`SmilChr04G003397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27951 (RGF3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057805036.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805036.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805036.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805036.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805036.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50510619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:50510647`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A10,A13,A7,A9,B102,B106,B11,B111,B113,B12,B120,B131,B133,B134,B137,B138,B18,B24,B28,B30,B31,B4,B55,B60,B65,B66,B8,B84,B86,B91,B98,C20,C21,C26,C35,C36,C47,C48,C49,C5,C59,C6,C72,C76,C80,C81,D2,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805036.1

113 aa

113

RGF3

PF27951 RGF3 71-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805036.1`	Pfam	`PF27951`	RGF3	Family	71	113	2.4e-09	38.7	GOLVEN 5/7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949053.1
ATTTTGCATGCAACGAAATAAGTTGAGGCAAATTTTTGGAGAAAAATAATAATGAAGTTTAACCTGCAGATTGTAACCTTGCTTTTCATAATATTTCTTGCTATGCAGGAAAATTCTTTTTCAGTACTTGCTCGTCCAGTGAAGAAAGTAAGTCATGTATTAACAACAAAGAAAGAGATGGCAGACAGTAGTGATTGCTTCAGTTTACCAAAGGAAATTGTTGCAGTTGAAAGATTTGCAAGAAAATTGACAGCTGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020315
ATGAAGTTTAACCTGCAGATTGTAACCTTGCTTTTCATAATATTTCTTGCTATGCAGGAAAATTCTTTTTCAGTACTTGCTCGTCCAGTGAAGAAAGTAAGTCATGTATTAACAACAAAGAAAGAGATGGCAGACAGTAGTGATTGCTTCAGTTTACCAAAGGAAATTGTTGCAGTTGAAAGATTTGCAAGAAAATTGACAGCTGAAGTGGCAAAGAAGGCGGTTTCCCATTCTCTTGGAAACAGAAAAGGTGAAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805036.1
MKFNLQIVTLLFIIFLAMQENSFSVLARPVKKVSHVLTTKKEMADSSDCFSLPKEIVAVERFARKLTAEVAKKAVSHSLGNRKGEEEEEEEDISTMAFSSDYHPPKPHPPKNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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