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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003400`

染色体: Chr04 坐标: 50549416-50550615 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003400`
名称	SmilChr04G003400
描述	uncharacterized SmilChr04G003400
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50549416 - 50550615 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023567`
GeneID	`131023567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023567`
原始查询	`SmilChr04G003400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=26; qcov=0.591; evalue=6.15e-09; confidence=low
Rice	`Os06g0683500` - identity=31; qcov=0.403; evalue=1.46e-11; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00075 (RNase_H); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809094.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809094.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809094.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057809094.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50549528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:50549918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B119,B91
`Chr4:50549968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50550078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:50550256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809094.1

352 aa

176

352

RNase_H

RVT_3

PF00075 RNase_H 162-284 aa PF13456 RVT_3 164-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809094.1`	Pfam	`PF00075`	RNase_H	Domain	162	284	1.6e-07	32.3	RNase H
`XP_057809094.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	164	283	2.3e-18	67.0	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953111.1
ATGGGGGACTTGGCTTTAGGAGAAGCATATTCCGGTACGTCGTTCTCTGGGGAGTCCATGGATCGTATTTTTTGGCAGTGCTCGAAGGTGCGCCCTCTTTGGCACAAGTTTTTGGATTGGTTTCAGCAGGCTCATATGTTGGATGCTTCGGACATTCACAGTTTCTTTGTTTACGCTTGGAATCAGAAGATGAGTCCTCAGATTGTTTGCTTCTGGAAAGCAGGAATCATTACTTTGATTTGGAGTTTGTGGAGTCAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023567
ATGGGGGACTTGGCTTTAGGAGAAGCATATTCCGGTACGTCGTTCTCTGGGGAGTCCATGGATCGTATTTTTTGGCAGTGCTCGAAGGTGCGCCCTCTTTGGCACAAGTTTTTGGATTGGTTTCAGCAGGCTCATATGTTGGATGCTTCGGACATTCACAGTTTCTTTGTTTACGCTTGGAATCAGAAGATGAGTCCTCAGATTGTTTGCTTCTGGAAAGCAGGAATCATTACTTTGATTTGGAGTTTGTGGAGTCAACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809094.1
MGDLALGEAYSGTSFSGESMDRIFWQCSKVRPLWHKFLDWFQQAHMLDASDIHSFFVYAWNQKMSPQIVCFWKAGIITLIWSLWSQRNRCIFEDESFAPMRFLQVVKVSFLDMENNFTKLGSMHNSCDDLLVVKNIGVRPRAYPSPEFINVYWWPPVNNWIKVNTDGSALGAPGKIGAGGVFRDKFSWVRGCFHVKGGIGFAFEAELLAVITAIQIAHARHWRQLWIESDSTYIVHLRHERSTSVPWRFAAIWKRILLLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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