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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003415`

染色体: Chr04 坐标: 50763791-50764399 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003415`
名称	SmilChr04G003415
描述	uncharacterized SmilChr04G003415
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50763791 - 50764399 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023570`
GeneID	`131023570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023570`
原始查询	`SmilChr04G003415`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993]; symbol=AT5G28780; hit=AT5G28780; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993]; symbol=AT5G28780; hit=AT5G28780; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G28780` (AT5G28780) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=40.7; qcov=0.985; evalue=8.78e-45; confidence=medium
Rice	`Os07g0255200` - identity=38.9; qcov=0.891; evalue=5.84e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809097.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809097.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809097.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809097.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50763826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:50763903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50763908`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B10,B134,B23,C30,C43
`Chr4:50763908`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B10,B134,B23,C30,C43
`Chr4:50763919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B39,B73,B82,C1
`Chr4:50763920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C83
`Chr4:50763946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B23,C30,C43
`Chr4:50763955`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B134,B23,C30
`Chr4:50763955`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B134,B23,C30
`Chr4:50763976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B134,B23,B76,C30
`Chr4:50763991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B40
`Chr4:50763996`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A10,A21,B126,B131,B20,B26,B36,B37,B41,B71,B82,B89,C1,C14,C24,C3,C4,C45,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809097.1

202 aa

101

202

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 85-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809097.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	85	131	1.2e-19	70.4	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953114.1
ATGATAATACGAGATTCAAGTAATCCTATTGCATCCATAGTGAAAAGTACTTATCAAGACGTACTGCATACCCTGTCTAATCCAGAATATTTTAAGGATAGAGCTATCCTGGCCCCAACCAATGATATGGTTGATTCGATTAATGAATATGTCATGTCCTTGATGCCTACCAAAGAAAGGGTATACCTTAGCTCAGATAACATTTGCAAAGATGATGGAGAAGTTGACCTCGATGATGAAGTCTTTTCAGTTGAGTATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023570
ATGATAATACGAGATTCAAGTAATCCTATTGCATCCATAGTGAAAAGTACTTATCAAGACGTACTGCATACCCTGTCTAATCCAGAATATTTTAAGGATAGAGCTATCCTGGCCCCAACCAATGATATGGTTGATTCGATTAATGAATATGTCATGTCCTTGATGCCTACCAAAGAAAGGGTATACCTTAGCTCAGATAACATTTGCAAAGATGATGGAGAAGTTGACCTCGATGATGAAGTCTTTTCAGTTGAGTATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809097.1
MIIRDSSNPIASIVKSTYQDVLHTLSNPEYFKDRAILAPTNDMVDSINEYVMSLMPTKERVYLSSDNICKDDGEVDLDDEVFSVEYLNMIKCSRLPSHEIKLKEGCIIMLLRNIDPSNELCNGTRMIVTKLGARVIEAKLISGNYAGKKFPIARMIMSPSDFTKFSIRFQRRQFPLSLCFAMTINKSQGQSLANVGLYDYTY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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