当前解析结果
SmilChr04G003430| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003430 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003430 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003430 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 50877702 - 50879626 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020324 |
|---|---|
| GeneID | 131020324 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020324 |
| 原始查询 | SmilChr04G003430 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | myb-like protein Q [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833915]; symbol=AT5G39200; hit=AT5G39200; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | myb-like protein Q [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833915]; symbol=AT5G39200; hit=AT5G39200; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G39200 (AT5G39200)myb-like protein Q [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833915] identity=28.9; qcov=0.838; evalue=3.3e-10; confidence=low |
| Rice | Os01g0193400 (OsSTA6)- identity=33.6; qcov=0.583; evalue=1.14e-06; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020324 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057805041.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805041.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805041.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805041.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805041.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:50878060 |
CTG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 15 | A20,B122,B126,B18,B38,B39,B58,B62,B69,B80,B95,C13,C30,C76,D8 |
Chr4:50878311 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr4:50878353 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,C32,C68 |
Chr4:50878392 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:50878611 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。