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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003431`

染色体: Chr04 坐标: 50889135-50892864 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003431`
名称	SmilChr04G003431
描述	exocyst complex component EXO70E2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50889135 - 50892864 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020325`
GeneID	`131020325`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020325`
原始查询	`SmilChr04G003431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exocyst complex component EXO70E2-like
产物	exocyst complex component EXO70E2-like
Arabidopsis	`AT5G61010` (EXO70E2) exocyst subunit exo70 family protein E2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836222] identity=38.4; qcov=0.945; evalue=3.44e-145; confidence=medium
Rice	`Os01g0763750` (OsEXO70X1) - identity=35.9; qcov=0.832; evalue=3.34e-104; confidence=medium
GO	GO:0000145 (exocyst); GO:0005546 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding); GO:0006887 (exocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF03081 (Exo70_C); PF20669 (Exo70_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020325

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805044.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805044.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057805044.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805044.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50890882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:50891005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr4:50891350`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B85
`Chr4:50891350`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B85
`Chr4:50891556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B24,B46
`Chr4:50891579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:50891580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B41,B84,C55
`Chr4:50891582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:50891612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B81,B91,C21,C6
`Chr4:50891699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50891726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:50891733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805044.1

673 aa

336

673

Exo70_N

Exo70_C

PF20669 Exo70_N 121-183 aa PF03081 Exo70_C 306-656 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805044.1`	Pfam	`PF20669`	Exo70_N	Repeat	121	183	3.7e-08	34.2	Exocyst complex component Exo70 N-terminal
`XP_057805044.1`	Pfam	`PF03081`	Exo70_C	Repeat	306	656	4.1e-98	329.6	Exo70 exocyst complex subunit C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949061.1
AACTTTGATATTTATTTATAAATTAACAATTAAATAATAATAACTAATAACAGCATGATTCGAATCCAAAACTTTTGACATTAGAACATTCACAACAAAGAACCCCTAATGGTTAGGGGCTCTCTGGAGAGCAGAGGCTACATAGCCACCCCACAAAAATAAAATGTTAAATGAAATTAAAAATTTATTAAATTGAAACTTGAAAATTATAATAATCCTAAAAAATTTACATTAAAAATAAAATTTAAAATTACATCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020325
ATGCTCTTCAAAAACCTTGATTTACCGATATTCCACAACAAAAAGATTCAATCTTTGCTCTCCATTCAACAACCAAAACAGCCTCATTTTCTTCATTCAAGAACAAGTCGTGAGCCGATGGCCGATATCACCGATGCGGAACGTCACGTTGTTGCCGCATCGTATCACCTGGTCAAGGCCCTTCAAGCAACCAAGATCCTGAGCAATGATGCGAGGAGACTTCTCGAAGACCTCGACGTCCATTTGTCCACAGTGATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805044.1
MLFKNLDLPIFHNKKIQSLLSIQQPKQPHFLHSRTSREPMADITDAERHVVAASYHLVKALQATKILSNDARRLLEDLDVHLSTVIKLNENESKADNIRELETRLVSSHQTIMSLHSSYSKIWASNPVIVLEYLQAVGEVQRLIEILEDMPLNRLRKEVLDQAKTTLQMAMDRLQNELIHTLVQNRQCFEHEYVSSLPVCEVYPIYEESVISNEDDSVEDASLKGRSSSETEECAMDLIHPDVVPQIKSIADTMFASGYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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