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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003440`

染色体: Chr04 坐标: 50929655-50931651 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003440`
名称	SmilChr04G003440
描述	protein ISD11
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50929655 - 50931651 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020333`
GeneID	`131020333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020333`
原始查询	`SmilChr04G003440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ISD11
产物	protein ISD11
Arabidopsis	`AT5G61220` (AT5G61220) LYR family of Fe/S cluster biosis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836243] identity=53.2; qcov=0.908; evalue=3.57e-27; confidence=medium
Rice	`Os08g0239000` - identity=74.7; qcov=1; evalue=3.58e-38; confidence=medium
GO	GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly)
KEGG	-
Pfam	PF05347 (Complex1_LYR); PF13233 (Complex1_LYR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805054.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057805054.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805054.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805054.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805054.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50929753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,A24,D7
`Chr4:50929762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B60
`Chr4:50929878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:50929891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B139,B62,C18,C22
`Chr4:50929899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805054.1

87 aa

Complex1_LYR

Complex1_LYR_2

PF05347 Complex1_LYR 8-65 aa PF13233 Complex1_LYR_2 10-55 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805054.1`	Pfam	`PF05347`	Complex1_LYR	Family	8	65	2.3e-20	73.0	Complex 1 protein (LYR family)
`XP_057805054.1`	Pfam	`PF13233`	Complex1_LYR_2	Family	10	55	8.1e-06	27.2	Complex1_LYR-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949071.1
GAAACTATAAAAAGATTTTCCCATAAAACCTGACGTTTAGAGGAGAGGGGAGAAGAAGAAATGGCGACGGCACCCACGCGCCGCGAAGTGCTCTCGCTCTTTCGATCGTTCATGCGGACTGCACGTGAGTTCACGGACTACAACATCAGGGAGTACGCCAAACGCCGCGCCGTTGACGCGTTCCGCCAAAACCGCCACCTGTCCGACCCTGCGGAGGTCGCCGCCGCCTTCGCCGACGGAAAGTCGCAGCTCGGCGTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020333
ATGGCGACGGCACCCACGCGCCGCGAAGTGCTCTCGCTCTTTCGATCGTTCATGCGGACTGCACGTGAGTTCACGGACTACAACATCAGGGAGTACGCCAAACGCCGCGCCGTTGACGCGTTCCGCCAAAACCGCCACCTGTCCGACCCTGCGGAGGTCGCCGCCGCCTTCGCCGACGGAAAGTCGCAGCTCGGCGTCGCCAAACGCCAGGCCGTCGTCTACTCGCTCTATGCCCCCTCAATTAAGAGCGTTATGGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805054.1
MATAPTRREVLSLFRSFMRTAREFTDYNIREYAKRRAVDAFRQNRHLSDPAEVAAAFADGKSQLGVAKRQAVVYSLYAPSIKSVMEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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