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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003441`

染色体: Chr04 坐标: 50935472-50938412 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003441`
名称	SmilChr04G003441
描述	SNAP25 homologous protein SNAP33
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50935472 - 50938412 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020335`
GeneID	`131020335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020335`
原始查询	`SmilChr04G003441`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNAP25 homologous protein SNAP33
产物	SNAP25 homologous protein SNAP33
Arabidopsis	`AT5G61210` (SNAP33) soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 33 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836242] identity=64.3; qcov=1.02; evalue=5.79e-121; confidence=high
Rice	`Os02g0529500` - identity=61.3; qcov=0.821; evalue=7.16e-98; confidence=high
GO	GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0031201 (SNARE complex)
KEGG	-
Pfam	PF05739 (SNARE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805056.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805057.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057805057.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057805056.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057805056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50935707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C8
`Chr4:50935825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	60	A18,A20,A24,A3,A5,B104,B106,B109,B117,B121,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B138,B14,B15,B17,B19,B23,B37,B46,B48,B52,B55,B56,B57,B60,B63,B64,B65,B70,B74,B75,B80,B81,B83,B89,B90,B92,B96,C1,C18,C23,C25,C26,C28,C33,C49,C54,C55,C59,C64,C66,C71,C87,D1,D6
`Chr4:50935932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B75,C73,C74,D11
`Chr4:50936330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B76,C16,D5
`Chr4:50936572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:50936587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B57,B88
`Chr4:50936590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B76,C16,D5
`Chr4:50936593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B118,B88,C58
`Chr4:50936931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B107
`Chr4:50936935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C40
`Chr4:50937028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B118,B88,C58
`Chr4:50937151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805060.1

274 aa

137

274

SNARE

PF05739 SNARE 214-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805060.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	214	272	4.4e-08	33.6	SNARE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949074.1
AGGTTGATTCGATAGAGTGACGTCAGCTTCACGCTCTTCCTCAATCTTTCTCATTTCTTTCTGTTGTGTTGAATTGAACAATTATTATCACAAAGTTCCATTTTTTGACTAAAAATTCCATTAATATTCCCGTTTTGTCTGTAATGAACCCAACCCACTTCTAAATCTGTCTCCCTCCCTCTCTCTCTGTATTTTCTCGGTCTAGATTTGTTGAATTTTGTTTTGGAAAGGGGCGTTACTCTCAGAGCGCTCCACCAATA...

XM_057949077.1
ACGCTCTTCCTCAATCTTTCTCATTTCTTTCTGTTGTGTTGAATTGAACAATTATTATCACAAAGTTCCATTTTTTGACTAAAAATTCCATTAATATTCCCGTTTTGTCTGTAATGAACCCAACCCACTTCTAAATCTGTCTCCCTCCCTCTCTCTCTGTATTTTCTCGGTCTAGATTTGTTGAATTTTGTTTTGGAAAGGGGCGTTACTCTCAGAGCGCTCCACCAATAGCAAGATCACCCCTTATCCTTGATATTCAG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131020335
ATGCATGGTGCAAAGAAATCTCCCTTGCACGGTTTGTCTAAACACACCTCAGCTGATACCAGGCGCCCCGTCAATATGCCTTCTAGTAATCCTTTTGACTCTGATGATGAATTGGATAACAAGCAAACCCCCAAACTATCTGGAAGAACATCTTCTGAACCTTCTTCTCTCTTTGCATCAAATTTAAGCACGAATCCTTTTGATGATGAAGAGGGAAATGGTAGCTCCTCATCTCAAAGAAGATACAAGAACGGTTTCCA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057805056.1
MHGAKKSPLHGLSKHTSADTRRPVNMPSSNPFDSDDELDNKQTPKLSGRTSSEPSSLFASNLSTNPFDDEEGNGSSSSQRRYKNGFHDSGGLENQSVQELENYAAYRAEETTKAVNNCLKIADDIRETATETLVNLHQQGEQIARTHMVAADMDHDLSRGEKLLGSLGGIFSKTWKPKRTRPITGPVITRDDPVQRNGNHLEQRERLGLTSASKEHTRTRTPPPEPASAMQKVEVEKVKQDDAFSDLSNILGELKEMAMD...

XP_057805057.1
MHGAKKSPLHGLSKHTSADTRRPVNMPSSNPFDSDDELDNKQTPKLSGRTSSEPSSLFASNLSTNPFDDEEGNGSSSSQRRYKNGFHDSGGLENQSVQELENYAAYRAEETTKAVNNCLKIADDIRETATETLVNLHQQGEQIARTHMVAADMDHDLSRGEKLLGSLGGIFSKTWKPKRTRPITGPVITRDDPVQRNGNHLEQRERLGLTSASKEHTRTRTPPPEPASAMQKVEVEKVKQDDAFSDLSNILGELKEMAMD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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