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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003444`

染色体: Chr04 坐标: 50955558-50956148 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003444`
名称	SmilChr04G003444
描述	uncharacterized SmilChr04G003444
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50955558 - 50956148 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023572`
GeneID	`131023572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023572`
原始查询	`SmilChr04G003444`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=28.6; qcov=0.786; evalue=3.77e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.2; qcov=0.76; evalue=4.08e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809099.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809099.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809099.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809099.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50955584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B4,B47,B99,C43,C61,C66
`Chr4:50955595`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B104,B4,B47,B99,C43,C61,C66
`Chr4:50955599`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B4,B47,B99,C43,C61,C66
`Chr4:50955603`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B35
`Chr4:50955603`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B35
`Chr4:50955605`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	108	A10,A11,A13,A15,A16,A20,A22,A24,A25,A3,A5,A9,B102,B103,B104,B106,B108,B109,B111,B114,B117,B119,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B2,B20,B29,B35,B37,B38,B4,B45,B46,B47,B48,B50,B51,B55,B56,B57,B59,B63,B65,B66,B70,B74,B75,B76,B77,B79,B80,B81,B83,B84,B86,B89,B9,B95,B96,B99,C11,C12,C15,C16,C17,C18,C23,C25,C26,C28,C3,C33,C36,C39,C43,C46,C50,C51,C52,C54,C55,C59,C61,C62,C64,C66,C67,C72,C73,C77,C83,D1,D3,D6
`Chr4:50955609`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C23,C46,C61
`Chr4:50955609`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C23,C46,C61
`Chr4:50955624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B118,B88,C58
`Chr4:50955625`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B104,B2,C73
`Chr4:50955625`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B104,B2,C73
`Chr4:50955650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	75	A18,A19,A25,A4,A6,A8,A9,B104,B105,B11,B111,B115,B119,B128,B129,B132,B133,B135,B137,B16,B2,B28,B32,B34,B36,B40,B45,B47,B49,B67,B68,B71,B72,B73,B78,B82,B83,B90,B92,B94,B97,B99,C14,C16,C19,C22,C24,C25,C29,C3,C30,C31,C34,C35,C43,C44,C45,C46,C50,C52,C53,C57,C61,C73,C74,C75,C77,C78,C81,C82,C84,C85,C9,D1,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809099.1

196 aa

196

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809099.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	148	3.2e-18	66.9	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953116.1
ATGGGTATGTTTAGAGAGGGTGAATGGGTGTGGAGTTTTATGTGGGAAAGAGCTTTTAATTTTTCTGATTTTGTGAATTTTGTGGAGTTGTGGTTTGTTCTTTACAGGATTTCTCTCCGCCACTCAGTGAGTGACTCTATCTTGTGGAAGGGTGCTAATGCTGGAAAATTTTCTACTAAGGAGATGTATTCAAACATCCACAAAGCTATCTTCACCGCGAATAACTCACCGGTTGCATTCAAAGACATTTGGGCTAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023572
ATGGGTATGTTTAGAGAGGGTGAATGGGTGTGGAGTTTTATGTGGGAAAGAGCTTTTAATTTTTCTGATTTTGTGAATTTTGTGGAGTTGTGGTTTGTTCTTTACAGGATTTCTCTCCGCCACTCAGTGAGTGACTCTATCTTGTGGAAGGGTGCTAATGCTGGAAAATTTTCTACTAAGGAGATGTATTCAAACATCCACAAAGCTATCTTCACCGCGAATAACTCACCGGTTGCATTCAAAGACATTTGGGCTAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809099.1
MGMFREGEWVWSFMWERAFNFSDFVNFVELWFVLYRISLRHSVSDSILWKGANAGKFSTKEMYSNIHKAIFTANNSPVAFKDIWAKGVPIKVSSFAWRALLDRIPTRENLLKRGIMLGNGGHCCPLCSCLLESTDHLLLLCMFSVKVWELIYKWMNISPISSVSLLEHFNEFVEQGENKKGKLMCNTIWQCVCWKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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