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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003446`

染色体: Chr04 坐标: 50971642-50976295 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003446`
名称	SmilChr04G003446
描述	plant intracellular Ras-group-related LRR protein 7
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50971642 - 50976295 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020340`
GeneID	`131020340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020340`
原始查询	`SmilChr04G003446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant intracellular Ras-group-related LRR protein 7
产物	plant intracellular Ras-group-related LRR protein 7
Arabidopsis	`AT5G07910` (AT5G07910) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830685] identity=72.8; qcov=1; evalue=1.73e-127; confidence=high
Rice	`Os03g0212200` (OsIRL7) - identity=55.5; qcov=0.525; evalue=6.92e-53; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805071.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805071.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.60000	`XP_057805071.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057805071.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057805071.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50973557`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A1,A2,A22,B118,B135,B138,B14,B17,B30,B60,B7,B73,B78,B8,B9,B96,C18,C27,C41,C43,C53,C63,C67,C77,C85,C87,D1
`Chr4:50973567`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B37,B85,B96,C16,C41,C87
`Chr4:50974686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B60
`Chr4:50976014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805071.1

261 aa

130

261

LRR_8

LRR_14

LRR_1

LRR_8

PF13855 LRR_8 68-125 aa PF23598 LRR_14 85-165 aa PF00560 LRR_1 114-135 aa PF00560 LRR_1 137-158 aa PF13855 LRR_8 161-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805071.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	68	125	1.7e-24	86.1	Leucine rich repeat
`XP_057805071.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	85	165	3.5e-25	89.2	Leucine-rich repeat region
`XP_057805071.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	114	135	3.3e-14	50.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057805071.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	137	158	3.3e-14	50.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057805071.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	161	218	1.7e-24	86.1	Leucine rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949088.1
AAAATTTTAAAAGATGGGACAAAAAAAGCAATATAAATTGGGAATTGGAGCATTACGACAAAAAGAAGGCCAGAATCGTACGCGGTTTCTTGTTCAAAGTCTACCCCATTTTCCCTCTCCTCTCATCATCGATCATCTCACACACATACATCTCCAAGAAAAAAACAATACCAGTTCTCTGGCAATCTGTTTGTGTTTTGATCGGTGAAGGGGGAGAAAAATTCAGCTCAGTTTTGAATGGGGTGCTGCACTAGCAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020340
ATGGGGTGCTGCACTAGCAAGAGCGCCGATTCTAAAGCCAGCCGCACCGCTCGCTGGCGCTCCACCGGAATTGTTGCCTTGCGCGACTCCAAATTGAAGACATTTCCAGATGAAGTTCTCGATTTGGAAAGATCAGTCCGCACGCTTGATTTGACGCACAACAAATTAGTTGATGTACCAATGGAGATAAACAAATTGATAAACTTGCAGCGGCTGATTTTAACTGACAATGTTATTGAACGTCTACCAATGAACTTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805071.1
MGCCTSKSADSKASRTARWRSTGIVALRDSKLKTFPDEVLDLERSVRTLDLTHNKLVDVPMEINKLINLQRLILTDNVIERLPMNLGKLQSLKVMALDGNRITTLPDEFGQLVKLEKLSISGNLLLNLPETIGSLRNLMLLNVSNNKIKFLPESIGSCFSLEEIQANENSIEELPSSVCSLVHLKSLCLDNNKVKQIPPNLLKDCKSLQNISLHGNPISMDDFQQMEGFEDFEGRRKRKFDKLIDSNVMINSKGLDEGVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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